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plateCore-package(plateCore)
plateCore-package()所属R语言包：plateCore

                                         plateCore: A Bioconductor package for high throughput analysis of flow cytometry data
                                         plateCore：Bioconductor高通量分析流式单元仪数据包

                                         译者：生物统计家园网 机器人LoveR

描述----------Description----------

plateCore is a Bioconductor packaged created to make processing and analysis of large, complex flow datasets in R easier. High throughput flow studies are often run in a 96 or 384-well plate format, with a number of different samples,  controls, and antibodies-dye conjugates present on the plate. Analyzing the output from the cytometer requires keeping track of the contents of each well, matching sample wells with control wells, gating each well/channel separately, making the appropriate plots, and summarizing the results. plateCore extends the flowCore and flowViz packages to work on flowPlate objects that represent these large flow datasets. For those familiar with flowCore and flowViz,  the gating (filtering), transformation, and other data manipulations for flowPlates are very similar to flowSets.
plateCore是一个的Bioconductor创建大型，复杂的流数据集的处理和分析，使研发更容易包装。高通量流研究往往运行在96或384孔板格式，用不同的样品，控制和抗体 - 染料共轭板的数量。分析从流式单元仪的输出，需要跟踪每口井的内容，匹配样品门每口井/通道分别控制井，水井，进行适当的图，总结的结果。 plateCore延伸flowCore和flowViz包flowPlate这些大流量的数据集对象表示。对于那些熟悉flowCore和flowViz，浇注（过滤），改造，和其他数据操作flowPlatesflowSets非常相似。


Details

详情----------Details----------


作者（S）----------Author(s)----------


Errol Strain, Florian Hahne, and Perry Haaland
Maintainer: Errol Strain <estrain@gmail.com>




参考文献----------References----------



举例----------Examples----------


library(plateCore)
data(plateCore)

## Get the lymphocytes[＃获取淋巴单元]
rectGate <- rectangleGate("FSC-H"=c(300,700),"SSC-H"=c(50,400))
pbmcPlate <- Subset(pbmcPlate, rectGate)

## Create a flowPlate object from the platePBMC and the wellAnnotation[＃创建一个从“platePBMC flowPlate对象的wellAnnotation]
fp <- flowPlate(pbmcPlate,wellAnnotation,plateName="P1")


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