R语言 pint包 join.top.regions()函数中文帮助文档(中英文对照)

loveR

join.top.regions(pint)
join.top.regions()所属R语言包：pint

                                         Merge the overlapping top chromosomal regions.
                                         合并顶级的染色体区域重叠。

                                         译者：生物统计家园网 机器人LoveR

描述----------Description----------

Select the top models that exceed the threshold and merge
选择的顶级车型，超过阈值和合并


用法----------Usage----------


join.top.regions(model, feature.info, quantile.th = 0.95, augment = FALSE)



参数----------Arguments----------

参数：model
Object of ChromosomeModels or GenomeModels class.
对象ChromosomeModels或GenomeModels类。


参数：feature.info
A data frame containing annotations for genes. For instance the geneExp$info table from our example data set (see data(chromosome17)).
一个数据框包含的基因注释。例如美元的geneExp从我们的例子中数据的详细信息表（见数据（chromosome17））。


参数：quantile.th
Threshold to define what quantile of the genes to include in the top region list, based on dependency scores for each gene.
阈值来定义什么分量的基因，包括在顶部区域“列表中，根据每个基因的依赖分数。


参数：augment
If TRUE, list also genes that were not used for modeling but available in the annotations (feature.info) and residing within the same region.
如果为TRUE，列表也没有造型，但可在注释（feature.info）和居住在同一区域使用的基因。


值----------Value----------

A list; each element is a vector of gene names that correspond
一个列表;每个元素是一个向量对应的基因名称


作者（S）----------Author(s)----------


Leo Lahti <a href="mailto:leo.lahti@iki.fi">leo.lahti@iki.fi</a>



参考文献----------References----------

<h3>See Also</h3>

举例----------Examples----------


## NOT RUN[＃无法运行]
# top.regions &lt;- join.top.regions(model, geneExp$info, quantile.th = 0.95)[top.regions < -  join.top.regions（模型，geneExp元信息，quantile.th = 0.95）]

转载请注明:出自 生物统计家园网(http://www.biostatistic.net)。


注：
注1：为了方便大家学习，本文档为生物统计家园网机器人LoveR翻译而成，仅供个人R语言学习参考使用，生物统计家园保留版权。
注2：由于是机器人自动翻译，难免有不准确之处，使用时仔细对照中、英文内容进行反复理解，可以帮助R语言的学习。
注3：如遇到不准确之处，请在本贴的后面进行回帖，我们会逐渐进行修订。