R语言 phenoTest包 epheno()函数中文帮助文档(中英文对照)

loveR · 发表于 2012-2-26 11:03:20

epheno(phenoTest)
epheno()所属R语言包：phenoTest

                                       epheno object.
                                       epheno对象。

                                       译者：生物统计家园网机器人LoveR

描述----------Description----------

Object obatined with ExpressionPhenoTest function.
对象obatined ExpressionPhenoTest功能。

用法----------Usage----------

data(epheno)

格式----------Format----------

The format is: Formal class 'epheno' [package "phenoTest"] with 8 slots ..@ p.adjust.method  : chr "none" ..@ assayData       :<environment: 0x1050d5a78>  ..@ phenoData       :Formal class 'AnnotatedDataFrame' [package "Biobase"] with 4 slots .. .. ..@ varMetadata    :'data.frame': 5 obs. of  1 variable: .. .. .. ..$ labelDescription: chr [1:5] NA NA NA NA ... .. .. ..@ data    :'data.frame': 12 obs. of  5 variables: .. .. .. ..$ phenoName : Factor w/ 3 levels "lymph.node.status",..: 3 3 3 3 3 1 1 1 2 3 ... .. .. .. ..$ phenoClass: Factor w/ 3 levels "categorical",..: 2 2 2 2 2 1 1 1 3 2 ... .. .. .. ..$ phenoType : Factor w/ 3 levels "mean","pval",..: 1 1 1 3 3 1 1 3 3 2 ... .. .. .. ..$ meanLabel : Factor w/ 5 levels "[45.2,49.2)",..: 1 2 3 NA NA 4 5 NA NA NA ... .. .. .. ..$ survTime  : Factor w/ 1 level "Months2Relapse": NA NA NA NA NA NA NA NA 1 NA ... .. .. ..@ dimLabels       : chr [1:2] "sampleNames" "sampleColumns" .. .. ..@ .__classVersion__:Formal class 'Versions' [package "Biobase"] with 1 slots .. .. .. .. ..@ .Data

ist of 1 .. .. .. .. .. ..$ : int [1:3] 1 1 0 ..@ featureData :Formal class 'AnnotatedDataFrame' [package "Biobase"] with 4 slots .. .. ..@ varMetadata :'data.frame': 0 obs. of 1 variable: .. .. .. ..$ labelDescription: chr(0) .. .. ..@ data :'data.frame': 1000 obs. of 0 variables .. .. ..@ dimLabels : chr [1:2] "featureNames" "featureColumns" .. .. ..@ .__classVersion__:Formal class 'Versions' [package "Biobase"] with 1 slots .. .. .. .. ..@ .Data

ist of 1 .. .. .. .. .. ..$ : int [1:3] 1 1 0 ..@ experimentData :Formal class 'MIAME' [package "Biobase"] with 13 slots .. .. ..@ name : chr "" .. .. ..@ lab : chr "" .. .. ..@ contact : chr "" .. .. ..@ title : chr "" .. .. ..@ abstract : chr "" .. .. ..@ url : chr "" .. .. ..@ pubMedIds : chr "" .. .. ..@ samples : list() .. .. ..@ hybridizations : list() .. .. ..@ normControls : list() .. .. ..@ preprocessing : list() .. .. ..@ other : list() .. .. ..@ .__classVersion__:Formal class 'Versions' [package "Biobase"] with 1 slots .. .. .. .. ..@ .Data

ist of 1 .. .. .. .. .. ..$ : int [1:3] 1 0 0 ..@ annotation : chr "hgu133a" ..@ protocolData :Formal class 'AnnotatedDataFrame' [package "Biobase"] with 4 slots .. .. ..@ varMetadata :'data.frame': 0 obs. of 1 variable: .. .. .. ..$ labelDescription: chr(0) .. .. ..@ data :'data.frame': 12 obs. of 0 variables .. .. ..@ dimLabels : chr [1:2] "sampleNames" "sampleColumns" .. .. ..@ .__classVersion__:Formal class 'Versions' [package "Biobase"] with 1 slots .. .. .. .. ..@ .Data

ist of 1 .. .. .. .. .. ..$ : int [1:3] 1 1 0 ..@ .__classVersion__:Formal class 'Versions' [package "Biobase"] with 1 slots .. .. ..@ .Data

ist of 4 .. .. .. ..$ : int [1:3] 2 12 0 .. .. .. ..$ : int [1:3] 2 10 0 .. .. .. ..$ : int [1:3] 1 3 0 .. .. .. ..$ : int [1:3] 1 0 0
格式是：正式类的epheno [包的“phenoTest”] 8槽.. @ p.adjust.method：“没有”CHR .. @ assayData：<environment: 0x1050d5a78> .. @ phenoData：正式类的AnnotatedDataFrame“包”BIOBASE“] 4槽...... .. .. @ varMetadata：“数据框”：5 OBS。 1变量：.. .. .. .. $ labelDescription：CHR [1:5] NA NA NA NA ... .. .. .. @数据：“数据框”：12 OBS。 5个变量：...... .. .. ..美元phenoName因素W / 3的水平“lymph.node.status”，..：3 3 3 3 3 1 1 1 2 3 ... .. .. .. .. $ phenoClass因素W / 3的水平“类别”，..：2 2 2 2 2 1 1 1 3 2 ... .. .. .. .. $型因子W / 3级“意味着”，“pval的”，......：1 1 1 3 3 1 1 3 3 2 ... .. .. .. .. $ meanLabel因素W / 5的水平“[45.2,49.2）”，..：1 2 3 NA NA NA NA NA 4 5 ... .. .. .. .. $ survTime因素W / 1级的“Months2Relapse”：不适用不适用不适用不适用不适用不适用不适用不适用1不适用... .. .. .. @ dimLabels：CHR [1:2]“sampleNames”的“sampleColumns”...... .. .. @ __classVersion__类的正式版本“[包”BIOBASE“] 1插槽...... .. .. .. 。.. @数据：1 .. .. .. .. .. .. $：INT [1:3] 1 1 0 .. @ featureData：正式类的AnnotatedDataFrame [包“BIOBASE”4个插槽...... .. .. @ varMetadata：“数据框”：0 OBS。 1变量：.. .. .. .. $ labelDescription：CHR（0）.. .. .. @数据：“数据框”：1000 OBS。 0变量...... .. .. @ dimLabels：CHR [1:2]“featureNames”的“featureColumns”...... .. .. @ __classVersion__类的正式版本“[包”BIOBASE“] 1插槽...... .. .. .. 。.. @数据：1 .. .. .. .. .. .. $：INT [1:3] 1 1 0 .. @ experimentData：正式类的MIAME [包“BIOBASE”] 13插槽...... .. .. @名称：CHR“...... .. .. @实验室：CHR“”...... .. .. @联系：CHR“...... .. .. @标题：CHR“...... .. ..摘要：CHR“...... .. .. @网址：CHR“...... .. .. @ pubMedIds的：CHR“...... .. .. @样本：列表（）.. .. .. @杂交列表（）.. .. .. @ normControls的：列表（）.. .. .. @预处理列表（）.. .. .. @其他列表（）。 .. .. @ __classVersion__类的正式版本“[包”BIOBASE“] 1插槽...... .. .. .. 。.. @数据：1 .. .. .. .. .. .. $：INT [1:3] 1 0 0 .. @注释：“hgu133a”CHR .. @ protocolData：正式类的AnnotatedDataFrame“包”BIOBASE“] 4槽...... .. .. @ varMetadata：“数据框”：0 OBS。 1变量：.. .. .. .. $ labelDescription：CHR（0）.. .. .. @数据：“数据框”：12 OBS。 0变量...... .. .. @ dimLabels：CHR [1:2]“sampleNames”的“sampleColumns”...... .. .. @ __classVersion__类的正式版本“[包”BIOBASE“] 1插槽...... .. .. .. 。.. @数据：1 .. .. .. .. .. .. $：INT [1:3] 1 1 0 .. @ __classVersion__类的正式版本“[包”BIOBASE“] 1插槽...... .. 。.. @数据：4 .. .. .. .. $：INT [1:3] 2月12日0 .. .. .. .. $：INT [1:3] 2 10 0 .. .. .. .. $：INT [1:3] 1 3 0 ...... .. .. .. $：INT [1:3] 1 0 0

举例----------Examples----------

data(epheno)
## maybe str(epheno) ; plot(epheno) ...[＃也许STR（epheno）;图（epheno）...]

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注：
注1：为了方便大家学习，本文档为生物统计家园网机器人LoveR翻译而成，仅供个人R语言学习参考使用，生物统计家园保留版权。
注2：由于是机器人自动翻译，难免有不准确之处，使用时仔细对照中、英文内容进行反复理解，可以帮助R语言的学习。
注3：如遇到不准确之处，请在本贴的后面进行回帖，我们会逐渐进行修订。

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