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R语言 PGSEA包 readGmt()函数中文帮助文档(中英文对照)

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发表于 2012-2-26 11:00:51 | 显示全部楼层 |阅读模式
readGmt(PGSEA)
readGmt()所属R语言包:PGSEA

                                         readGmt
                                         readGmt

                                         译者:生物统计家园网 机器人LoveR

描述----------Description----------

This function will read a "gmt" file into R, returning results as a list of SMC objects.
此功能将读入R“GMT”文件,返回的结果作为SMC的对象名单。


用法----------Usage----------


readGmt(fname)



参数----------Arguments----------

参数:fname
File name of concepts in .gmt format  
概念。GMT格式的文件名称


Details

详情----------Details----------

The .gmt file format is a tab delimited file format used to store gene lists. These gene lists are stored row by row. The first column is the gene set name. The second column is a brief description, and every entry after that is a gene within that gene set.
文件格式。GMT是一个制表符分隔的文件格式,用于存储基因名单。这些基因列表存储鳞次栉比。第一列是基因组的名称。第二列是一个简短的描述,每一个条目后,这是一个基因,基因组内。


值----------Value----------

A list of SMC objects
SMC的对象名单


作者(S)----------Author(s)----------


Karl Dykema <karl.dykema@vai.org>



参考文献----------References----------

<h3>See Also</h3>

举例----------Examples----------



        datadir <- system.file("extdata", package = "PGSEA")
        sample <- readGmt(file.path(datadir, "sample.gmt"))
        str(sample)



转载请注明:出自 生物统计家园网(http://www.biostatistic.net)。


注:
注1:为了方便大家学习,本文档为生物统计家园网机器人LoveR翻译而成,仅供个人R语言学习参考使用,生物统计家园保留版权。
注2:由于是机器人自动翻译,难免有不准确之处,使用时仔细对照中、英文内容进行反复理解,可以帮助R语言的学习。
注3:如遇到不准确之处,请在本贴的后面进行回帖,我们会逐渐进行修订。
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