readGmt(PGSEA)
readGmt()所属R语言包:PGSEA
readGmt
readGmt
译者:生物统计家园网 机器人LoveR
描述----------Description----------
This function will read a "gmt" file into R, returning results as a list of SMC objects.
此功能将读入R“GMT”文件,返回的结果作为SMC的对象名单。
用法----------Usage----------
readGmt(fname)
参数----------Arguments----------
参数:fname
File name of concepts in .gmt format
概念。GMT格式的文件名称
Details
详情----------Details----------
The .gmt file format is a tab delimited file format used to store gene lists. These gene lists are stored row by row. The first column is the gene set name. The second column is a brief description, and every entry after that is a gene within that gene set.
文件格式。GMT是一个制表符分隔的文件格式,用于存储基因名单。这些基因列表存储鳞次栉比。第一列是基因组的名称。第二列是一个简短的描述,每一个条目后,这是一个基因,基因组内。
值----------Value----------
A list of SMC objects
SMC的对象名单
作者(S)----------Author(s)----------
Karl Dykema <karl.dykema@vai.org>
参考文献----------References----------
<h3>See Also</h3>
举例----------Examples----------
datadir <- system.file("extdata", package = "PGSEA")
sample <- readGmt(file.path(datadir, "sample.gmt"))
str(sample)
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注:
注1:为了方便大家学习,本文档为生物统计家园网机器人LoveR翻译而成,仅供个人R语言学习参考使用,生物统计家园保留版权。
注2:由于是机器人自动翻译,难免有不准确之处,使用时仔细对照中、英文内容进行反复理解,可以帮助R语言的学习。
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