R语言 PGSEA包 aggregateExprs()函数中文帮助文档(中英文对照)

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aggregateExprs(PGSEA)
aggregateExprs()所属R语言包：PGSEA

                                        Aggregate expression data
                                         聚合表达式数据

                                         译者：生物统计家园网 机器人LoveR

描述----------Description----------

This function removes duplicates row names from an expression set, summarizing them with a function of the users choice. The "absMax" function located in package "reb" we have found to be useful.
这个函数删除重复行的名称，从一个表达式集，总结他们与用户选择的功能。 “absMax”功能包“篮板”我们已经找到了有用的。


用法----------Usage----------


aggregateExprs(x, package = "hgu133plus2", using = "ENTREZID", FUN, ...)



参数----------Arguments----------

参数：x
expression data - matrix, eSet, or ExpressionSet  
表达数据 - 矩阵，ESET，ExpressionSet的


参数：package
annotation package of expression data  
注释表达数据包


参数：using
format type that gene IDs are converted to   
基因标识转换的格式类型


参数：FUN
function by which to summarize duplicated values  
功能，利用它来概括重复值


参数：...
extra parameters passed on to FUN  
额外的参数传递到有趣


值----------Value----------

A matrix of expression data with the rows aggregated to a unique format chosen by the user. The new identifiers of the returned matrix are those specified with the "using" argument. To see possible values, use the ls() command illustrated below in the examples.
矩阵的表达与行的数据汇总到一个独特的格式，由用户选择。返回矩阵的新标识符所指定的“使用”的说法。要看到可能的值，使用ls（）命令，在下面的例子说明。


作者（S）----------Author(s)----------


Kyle Furge <kyle.furge@vai.org> and Karl Dykema <karl.dykema@vai.org>



举例----------Examples----------


        if (require(hgu95av2.db) & require(annaffy)) {
                library(annaffy)
                data(aafExpr)
                class(exprs(aafExpr))
                exprs(aafExpr)[1:4, 1:4]

                #list possible values for the "using" argument[列出可能值“使用”的说法]
                ls(pos=which(search()=="package:hgu95av2.db"))

                convert <- aggregateExprs(exprs(aafExpr),"hgu95av2.db",FUN=mean,na.rm=TRUE)
                convert[1:4,1:4]
        }

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