R语言 PCpheno包 YEASTOHNOLOG()函数中文帮助文档(中英文对照)

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YEASTOHNOLOG(PCpheno)
YEASTOHNOLOG()所属R语言包：PCpheno

                                        List of ohnolog gene pairs from Byrne, K.P and Wolfe, K.H (2005)
                                         的ohnolog基因对名单拜恩，KP和沃尔夫，锦（2005）

                                         译者：生物统计家园网 机器人LoveR

描述----------Description----------

List of 551 paralogous Saccharomyces cerevisiae gene pairs formed by Whole Genome Duplication (WGD) or ohnolog pairs.
551旁系酿酒酵母基因形成对全基因组重复（WGD）或ohnolog的的双名单。


用法----------Usage----------


data(YEASTOHNOLOG)



格式----------Format----------

YEASTOHNOLOG is a dataframe of 551 paired genes. The first two columns are the ohnolog gene pairs (systematic gene names). The third column is an index (numeric) of the  rate of sequence evolution. The last two columns define the chromosome location.
YEASTOHNOLOG是dataframe 551配对基因。前两列是对ohnolog基因（系统基因的名称）。第三列是一个序列进化速率指数（数字）。最后两列定义的染色体上的位置。


Details

详情----------Details----------




Gene1 Gene2 Systematic gene names of the ohnolog pairs
gene1 Gene2的ohnolog对系统的基因名称




Ka Coefficient that represents the extent of non-synonymous sequence divergence between each ohnolog pairs (Yang and Nielsen, 2000). The highest is the coefficient
嘉系数表示非同义彼此之间ohnolog对序列差异（杨和尼尔森，2000年）的程度。最高的是系数




ChrG1 ChrG2 Chromosome location of the each element of a pair. Note that repeat of the same chromosome locations shared by
ChrG1 ChrG2的每个元素的一对染色体的位置。需要注意的是分享相同的染色体位置重演


作者（S）----------Author(s)----------


N. LeMeur



源----------Source----------

Byrne,KP and Wolfe KH (2005), Table2 of supplementary information and Scerevisiae\_genome.tab file, chromosome location, from YGOB http://wolfe.gen.tcd.ie/ygob/ (last update 03/20/06)
拜恩，KP和沃尔夫锦（2005），补充信息和Scerevisiae表2 \ _genome.tab文件，染色体上的位置从YGOB http://wolfe.gen.tcd.ie/ygob/，（最后更新06年3月20日）


参考文献----------References----------

reveals gene fate in polyploid species. Genome Res. 15(10):1456-61.  PMID: 16169922

举例----------Examples----------


data(YEASTOHNOLOG)
str(YEASTOHNOLOG)

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