R语言 PCpheno包 KEGG2SCISI()函数中文帮助文档(中英文对照)

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KEGG2SCISI(PCpheno)
KEGG2SCISI()所属R语言包：PCpheno

                                        Mapping between KEGG and ScISI
                                         KEGG和ScISI之间的映射

                                         译者：生物统计家园网 机器人LoveR

描述----------Description----------

Count the number of genes shared between a KEGG pathway and a protein complex from the ScISI interactome.
计数KEGG通路和蛋白质复合体从ScISI相互作用组之间共享的基因数量。


用法----------Usage----------


KEGG2SCISI(pw, pc, pcMat, pwMat)



参数----------Arguments----------

参数：pw
list of pathway names
通路名称列表


参数：pc
list of complex names
复杂的名称列表


参数：pwMat
pathway incidence matrix
通路的发病率矩阵


参数：pcMat
complex incidence matrix
复杂的关联矩阵


值----------Value----------

matrix
矩阵


作者（S）----------Author(s)----------


N. LeMeur



参见----------See Also----------

ScISI KEGG
ScISI KEGG


举例----------Examples----------


data(ScISIC)
## Mapping from Yeast genes to KEGG pathways.[＃从酵母基因测绘KEGG通路。]
KeggMat <- PWAmat("org.Sc.sgd")
KEGG2SCISI(pw = colnames(KeggMat)[1:5], pc = colnames(ScISIC)[1:5], pwMat =
KeggMat, pcMat =ScISIC)

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