MutationsBrain(PatientGeneSets)
MutationsBrain()所属R语言包：PatientGeneSets
Data from Parsons et al. study: Mutation counts
从帕森斯等人的数据。研究：突变计数
译者：生物统计家园网 机器人LoveR
描述----------Description----------
Mutation counts for RefSeq genes which are mutated in the
突变计数的RefSeq基因突变
用法----------Usage----------
data(Parsons)
格式----------Format----------
Data frame of number of mutations found in the glioblastoma dataset from the Parsons et al. study, broken down by gene, study phase (Validation or Discovery), and mutation type. For this study, there was only a Discovery stage. Entries are totals over all the samples sequenced in each phase. For convenience the data frame also replicates the Coverage and Gene Size information for the genes where mutations were found, and includes the total number of samples analyzed in each phase for each gene.
数据框在胶质母单元瘤集从帕森斯等人发现的突变。研究中，基因，研究阶段（验证或发现），突变类型划分。在这项研究中，只发现阶段。条目是在每个阶段的所有测序样本的总数。为了方便数据框复制的基因突变被发现的覆盖率和基因大小的信息，包括在每个阶段，每个基因分析样品总数。
作者（S）----------Author(s)----------
Simina M. Boca, Giovanni Parmigiani.
参考文献----------References----------
Carter H, Siu I, et al. An Integrated Genomic Analysis of Human Glioblastoma Multiforme. Science. DOI: 10.1126/science.1164382
Velculescu VE, Vogelstein B. Statistical methods for the analysis of cancer genome sequencing data. http://www.bepress.com/jhubiostat/paper126/
Parmigiani G. Patient-oriented gene-set analysis for cancer mutation data. Submitted, 2010.
参见----------See Also----------
do.gene.set.analysis, sim.data.p.values, SimMethodsSims-class, CoverageBrain, EventsBySampleBrain, GeneSizes08
do.gene.set.analysis，sim.data.p.values，SimMethodsSims-class，CoverageBrain，EventsBySampleBrain，GeneSizes08
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发表于 2012-2-26 10:24:34
