R语言 pathRender包 rendercMAPPathway()函数中文帮助文档(中英文对照)

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rendercMAPPathway(pathRender)
rendercMAPPathway()所属R语言包：pathRender

                                         Render pathways from cMAP
                                         渲染CMAP途径

                                         译者：生物统计家园网 机器人LoveR

描述----------Description----------

Build graphs based on pathway or interaction data from cMAP database,  render them using Rgraphviz.
CMAP数据库的途径或相互作用的数据为基础建立的图表，使他们使用Rgraphviz。


用法----------Usage----------


rendercMAPPathway(pname, ino=0)



参数----------Arguments----------

参数：pname
name of the pathway to render
通路的名称，使


参数：ino
index of the interaction in the given pathway to render
互动，在给定的途径呈现指数


Details

详情----------Details----------

For a given pathway in cMAP database, we build a subgraph for each interaction  in the pathway, join them together to form the graph for the complete pathway.  The subgraphs for interactions and the graph for the pathway include info for  rendering, such as labels/shapes/fillcolors for nodes, colors/styles/weights  for edges.  If user specifies an index of interaction, only the interaction is rendered.  Otherwise, the complete pathway is rendered.
对于给定的在CMAP数据库的途径，我们建立了一个子图中的每个通路的相互作用，一起加入他们的行列，形成了完整的通路图。相互作用和通路图的子图，包括信息，如标签的边缘节点，颜色/款式/重量/形状/ fillcolors的渲染。如果用户指定了一个互动的指数，只有交互渲染。否则，呈现完整的通路。


值----------Value----------

None.  A graphical output is presented.
没有。一个图形输出。


作者（S）----------Author(s)----------


Li Long <li.long@isb-sib.ch>



举例----------Examples----------


   rendercMAPPathway("plateletapppathway")
   rendercMAPPathway("plateletapppathway", 5)
   rendercMAPPathway("hsa00601")
   rendercMAPPathway("hsa00601", 10)

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注：
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注2：由于是机器人自动翻译，难免有不准确之处，使用时仔细对照中、英文内容进行反复理解，可以帮助R语言的学习。
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