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R语言 pathRender包 pwayGraph-class()函数中文帮助文档(中英文对照)

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发表于 2012-2-26 10:23:26 | 显示全部楼层 |阅读模式
pwayGraph-class(pathRender)
pwayGraph-class()所属R语言包:pathRender

                                        Class "pwayGraph" – extension to graphNEL for pathway rendering
                                         类“pwayGraph” - 延伸到通路渲染graphNEL

                                         译者:生物统计家园网 机器人LoveR

描述----------Description----------

extension to graphNEL for pathway rendering
延伸到通路渲染graphNEL


类的对象----------Objects from the Class----------

Objects can be created by calls of the form  new("pwayGraph", nodes, edgeL, edgemode).
创建对象可以通过检测的形式new("pwayGraph", nodes, edgeL, edgemode)。

There is a plot method that will work reasonably well if the plotting surface is big enough.
有一个图的方法,将工作合理,如果绘制表面足够大。


插槽----------Slots----------




pwaySource: Object of class "character" KEGG or BIOCARTA
pwaySource类"character"KEGG或BIOCARTA的对象




nodes: Object of class "vector" pathway constituents in the native vocabulary
nodes:对象类"vector"在本土词汇通路成分




edgeL: Object of class "list" constituent
edgeL:Object类的"list"组成




edgeData: Object of class "attrData" relationship
edgeData类"attrData"关系:对象




nodeData: Object of class "attrData" node
nodeData类"attrData"节点对象




renderInfo: Object of class "renderInfo" render info
renderInfo:Object类的"renderInfo"提供信息




graphData: Object of class "list" this holds the special rendering attributes for edges and nodes, for nodes it
graphData:Object类的"list"这个拥有特殊的渲染属性节点的边和节点,它


延伸----------Extends----------

Class graphNEL-class, directly. Class graph-class, by class "graphNEL", distance 2.
类graphNEL-class,直接。类graph-class,类“graphNEL”,距离为2。


方法----------Methods----------




plot signature(x = "pwayGraph"): renders the pathway
图signature(x = "pwayGraph"):呈现的途径


作者(S)----------Author(s)----------


Vince Carey <stvjc@channing.harvard.edu>



举例----------Examples----------


showClass("pwayGraph")
G1 = graphcMAP("stresspathway")
G1@graphData$nAttrs$labels[1:10]

转载请注明:出自 生物统计家园网(http://www.biostatistic.net)。


注:
注1:为了方便大家学习,本文档为生物统计家园网机器人LoveR翻译而成,仅供个人R语言学习参考使用,生物统计家园保留版权。
注2:由于是机器人自动翻译,难免有不准确之处,使用时仔细对照中、英文内容进行反复理解,可以帮助R语言的学习。
注3:如遇到不准确之处,请在本贴的后面进行回帖,我们会逐渐进行修订。
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