R语言 PAN包 summarize()函数中文帮助文档(中英文对照)

loveR

summarize(PAN)
summarize()所属R语言包：PAN

                                         Summarize the object of S4 class 'BetaMixture' or 'PAN'
                                         概括S4类的BetaMixture“或”泛“的对象

                                         译者：生物统计家园网 机器人LoveR

描述----------Description----------

The function helps print a summary of an object of S4 class BetaMixture or PAN.
的功能，可以打印对象的S4级BetaMixture或PAN摘要。


用法----------Usage----------


summarize(object, what='ALL', ...)



参数----------Arguments----------

参数：object
an object of S4 class BetaMixture or PAN.  
的S4类BetaMixture的对象或PAN。


参数：what
a character value specifying what to print (see details).  
指定打印字符值（见详情）。


参数：...
not in use, only for further extension.  
在不使用，仅用于进一步扩展。


Details

详情----------Details----------

This function print a summary of an object of BetaMixture or PAN. The function is also called by S4 method show, which prints only a short message about the input parameters and data.
此函数打印一个BetaMixture或PAN对象的总结。该功能也被称为S4方法show，打印的输入参数和数据只有一条短消息。

For an object of class BetaMixture:
对于一个类的对象BetaMixture：

If what='input', the function prints to screen a summary of input parameters; If what='fitNULL', the function prints to screen a summary of fitting results for the NULL distribution. If what='fitBM', the function prints to screen a summary of fitting results for the beta-mixture model. If what='ALL', all above messages will be printed.
如果what='input'，函数打印到屏幕上的一个输入参数的总结;如果what='fitNULL'，函数打印到屏幕上为NULL分布拟合结果摘要。如果what='fitBM'，功能打印筛选β-混合模型的拟合结果的摘要。如果what='ALL'，以上所有的信息会被打印。

For an object of class PAN:
对于一个类的对象PAN：

If what='input', the function prints to screen a summary of input object(s) of class BetaMixture; If what='graph', the function prints to screen a summary of inferred posterior association network; If what='module', the function prints to screen a summary of  functional gene modules; If what='ALL', all above messages will be printed.
如果what='input'，该函数打印到屏幕上的一个输入对象类BetaMixture（S）摘要;如果what='graph'，函数打印到屏幕上的一个总结的推断后协会网络;如果 what='module'，该函数打印到屏幕上的一个基因功能模块的总结; what='ALL'如果，所有上述消息将被打印。


作者（S）----------Author(s)----------



Xin Wang <a href="mailto:xw264@cam.ac.uk">xw264@cam.ac.uk</a>




参考文献----------References----------

and Florian Markowetz, Posterior association networks and enriched  functional gene modules inferred from rich phenotypic perturbation  screens, in preparation.

举例----------Examples----------


data(bm)
summarize(bm1, what='ALL')

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