R语言 PAN包 exportPAN()函数中文帮助文档(中英文对照)

loveR

exportPAN(PAN)
exportPAN()所属R语言包：PAN

                                         Export inferred PAN or module graphs to files
                                         图表推断PAN或模块导出文件

                                         译者：生物统计家园网 机器人LoveR

描述----------Description----------

Powered by function write.graph in package igraph, this function writes the  inferred PAN or module graphs to files in a variety of formats that are supported  by igraph.
功能供电write.graph包中igraph，这个函数中写道是由IGRAPH支持的各种格式的文件推断潘或模块图。


用法----------Usage----------


exportPAN(object, file="pan", what="graph", moduleID=1, format="gml",
verbose=TRUE, ...)



参数----------Arguments----------

参数：object
an object of S4 class PAN.  
S4类PAN的对象。


参数：file
the name of the file to write the graph or module (no need to put a filename  extension).  
文件名写的图或模块（不需要把文件扩展名）。


参数：what
a character value specifying what to write: "graph" or "pvclustModule".  
一个字符值，指定写什么：“图”或“pvclustModule。


参数：moduleID
a numeric or integer vector of modules to write (see details in sigModules).  
写一个模块的数字或整数向量（见细节sigModules）。


参数：format
a character value specifying the format to write (see more details in write.graph).  
指定的格式写一个字符值（见write.graph详情）。


参数：verbose
a logical value to switch on (if TRUE) or off if FALSE detailed run-time message.  
一个逻辑值切换（如果TRUE）或关闭，如果FALSE详细的运行时的消息。


参数：...
not in use, but only for further extension.  
在不使用，但仅用于进一步扩展。


值----------Value----------

a numeric vector of ids for significant gene modules
IDS的数字矢量显着的基因模块


作者（S）----------Author(s)----------



Xin Wang <a href="mailto:xw264@cam.ac.uk">xw264@cam.ac.uk</a>




举例----------Examples----------


## Not run: [＃无法运行：]
data(bm, package="PAN")
pan<-new("PAN", bm1=bm1)
pan<-infer(pan, para=list(type="SNR", log=TRUE, sign=TRUE, cutoff=log(5)),
filter=FALSE, verbose=TRUE)
data(Bakal2007Cluster, package="PAN")
pan<-buildPAN(pan, engine="igraph", para=list(nodeColor=nodeColor,
hideNeg=TRUE), verbose=TRUE)
exportPAN(pan, file="pan", what="graph", format="ncol")

## End(Not run)[＃结束（不运行）]

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注：
注1：为了方便大家学习，本文档为生物统计家园网机器人LoveR翻译而成，仅供个人R语言学习参考使用，生物统计家园保留版权。
注2：由于是机器人自动翻译，难免有不准确之处，使用时仔细对照中、英文内容进行反复理解，可以帮助R语言的学习。
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