R语言 PAN包 cosineSim()函数中文帮助文档(中英文对照)

loveR

cosineSim(PAN)
cosineSim()所属R语言包：PAN

                                         Compute cosine similarities or distances between pairs of genes
                                         计算余弦相似性或对基因之间的距离

                                         译者：生物统计家园网 机器人LoveR

描述----------Description----------

This function compute cosine similarities or distances between pairs of genes, given measured rich phenotypes.
这个函数的计算余弦相似性或对基因之间的距离，测量丰富的表型。


用法----------Usage----------


cosineSim(x)
cosineDist(x)



参数----------Arguments----------

参数：x
a numeric matrix of rich phenotypes with rows and columns specifying samples and genes, respectively.  
数字矩阵的行和列分别指定样本和基因，丰富的表型。


值----------Value----------

This function will return either a numeric matrix of cosine similarities or an object of dist.
这个函数将返回一个数字的余弦相似性矩阵或dist的对象的。


作者（S）----------Author(s)----------



Xin Wang <a href="mailto:xw264@cam.ac.uk">xw264@cam.ac.uk</a>




参考文献----------References----------

and Florian Markowetz, Posterior association networks and enriched  functional gene modules inferred from rich phenotypic perturbation  screens, in preparation.

参见----------See Also----------

assoScore
assoScore


举例----------Examples----------


toydata<-matrix(rnorm(n=2000, mean=0, sd=4), nrow=100, ncol=20)
toycossim<-cosineSim(t(toydata))
toycosdist<-cosineDist(t(toydata))

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