R语言 OTUbase包 assignmentData()函数中文帮助文档(中英文对照)

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assignmentData(OTUbase)
assignmentData()所属R语言包：OTUbase

                                        assignmentData
                                         assignmentData

                                         译者：生物统计家园网 机器人LoveR

描述----------Description----------

These accessors access and replace the assignmentData slot of OTUbase objects. assignmentData is an AnnotatedDataFrame. assignmentData and assignmentData<- access and replace this AnnotatedDataFrame. assignmentLabels and assignmentLabels<- access and replace the labels of this AnnotatedDataFrame. aData and aData<- access and replace the dataframe component of the AnnotatedDataFrame.
这些存取访问和更换的OTUbase对象assignmentData槽。 assignmentData是AnnotatedDataFrame。 assignmentData和assignmentData<-访问和取代这个AnnotatedDataFrame。 assignmentLabels和assignmentLabels<-访问取代本AnnotatedDataFrame标签的。 aData和aData<-访问和取代的AnnotatedDataFrame dataframe组件。

assignmentNames returns the assignment names present in the assignmentData slot.
assignmentNames返回assignmentData插槽分配名称。


用法----------Usage----------



    aData(object,...)
    aData(object)&lt;-value
    assignmentData(object,...)
    assignmentData(object)&lt;-value
    assignmentLabels(object,...)
    assignmentLabels(object)&lt;-value
    assignmentNames(object,...)




参数----------Arguments----------

参数：object
An OTUset or a TAXset object
OTUset或TAXset对象


参数：value
The replacement value for assignmentData or assignmentLabels
assignmentData或assignmentLabels替换值


参数：...
Added for completeness. Enables the passing of arguments.
新增的完整性。启用参数逝世。


值----------Value----------

aData returns a dataframe. assignmentData returns an AnnotatedDataFrame. assignmentLabels returns a character. assignmentNames returns a character.
aData返回一个dataframe。 assignmentData返回一个AnnotatedDataFrame。 assignmentLabels返回一个字符。 assignmentNames返回一个字符。


举例----------Examples----------



## locate directory with data[＃定位数据目录]
dirPath <- system.file("extdata/Sogin_2006", package="OTUbase")

## read in data into OTUset object[＃读取数据OTUset对象]
soginOTU <- readOTUset(dirPath=dirPath, level="0.03", samplefile="sogin.groups", fastafile="sogin.fasta", otufile="sogin.unique.filter.fn.list", sampleADF="sample_metadata.txt")

## get the aData dataframe[＃得到ADATA dataframe。]
aData(soginOTU)

## get the assignmentData slot[＃得到assignmentData插槽。]
assignmentData(soginOTU)


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