R语言 ontoTools包 ontology-class()函数中文帮助文档(中英文对照)

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ontology-class(ontoTools)
ontology-class()所属R语言包：ontoTools

                                        Class "ontology" wraps a rooted DAG with some
                                         类“本体论”包装与一些根深蒂固的DAG

                                         译者：生物统计家园网 机器人LoveR

描述----------Description----------

instances of class ontology are used to
本体类的实例用于


类的对象----------Objects from the Class----------

Objects can be created by calls of the form new("ontology", ...). This simply possesses information on name and version of ontology.
创建对象可以通过检测的形式new("ontology", ...)。这只是具有本体论上的名称和版本信息。


插槽----------Slots----------




name: Object of class "character" name of ontology
类本体名称name "character"：对象




version: Object of class "character" version tag
version类"character"版本标签：对象




rDAG: Object of class "rootedDAG" the rooted
rDAG：Object类的"rootedDAG"根深蒂固


方法----------Methods----------




accessMat signature(object = "ontology"): returns square matrix with 1 in element r,c if term corresponding
1元r accessMatsignature(object = "ontology")：返回与C如果术语相应的方阵，




name signature(x = "ontology"): access name
名称signature(x = "ontology")：访问名称




OVersion signature(x = "ontology"):  access version
OVersionsignature(x = "ontology")：访问版本




rDAG signature(x = "ontology"): access the rooted DAG
rDAGsignature(x = "ontology")：访问根深蒂固的DAG




show signature(object = "ontology"): concise report
显示signature(object = "ontology")：简要报告


注意----------Note----------

This class was written to deal with ontologies that are representable as rooted DAGs.  It is not clear that this is a good use of the term 'ontology', which has broader implications.  However this does work for Gene Ontology.
这个类被写入处理的本体，是根深蒂固的DAG表示。目前尚不清楚，这是一个良好的使用术语“本体论”，它具有更广泛的影响。然而，这确实为基因本体论的工作。


举例----------Examples----------


data(litOnto)
print(litOnto)
g1 <- new("rootedDAG", DAG=litOnto, root="A")
o1 <- new("ontology", name="demo", version="0.1",
        rDAG=g1)
# can also use[也可以使用]
o1b <- makeOntology( name="demo", version="0.1",
   graph=litOnto, root="A")
show(o1)
print(accessMat(o1))
print(OVersion(o1))

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注：
注1：为了方便大家学习，本文档为生物统计家园网机器人LoveR翻译而成，仅供个人R语言学习参考使用，生物统计家园保留版权。
注2：由于是机器人自动翻译，难免有不准确之处，使用时仔细对照中、英文内容进行反复理解，可以帮助R语言的学习。
注3：如遇到不准确之处，请在本贴的后面进行回帖，我们会逐渐进行修订。