R语言 oneChannelGUI包 cosieWrapper()函数中文帮助文档(中英文对照)

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cosieWrapper(oneChannelGUI)
cosieWrapper()所属R语言包：oneChannelGUI

                                        A wrapper to cosie, Corrected Splicing Indices for Exon arrays, that for any given set of new exon array experiments
                                         到cosie包装，纠正拼接外显子阵列指数为任何给定的一组新的外显子阵列实验

                                         译者：生物统计家园网 机器人LoveR

描述----------Description----------

COSIE is a function that for a given set of exon arrays corrects for the observed bias and improves  the detection of alternative splicing. It adjusts splicing indices for exons, especially for those that belong  to differentially expressed genes. For this adjustment, COSIE uses parameters that are specific for each probeset  which were trained from a large number of published exon arrays. The downside of this approach is that such parameters  cannot be estimated for all probesets on the microarray. Based on our training set, COSIE corrects 95.1 percent  of the probesets. Separate parameter files are provided for both the full and core sets, including all  probesets that are linked to transcripts. We recommend the use of the core set that was also used in the cited study below.
COSIE是一个函数，对于给定的外显子阵列更正所观察到的偏差，提高检测剪接。外显子的剪接指数调整，特别是对那些属于差异表达基因。对于这种调整，COSIE使用每个probeset从公布的外显子阵列的大量训练的具体参数。这种方法的缺点是，这些参数不能为芯片probesets估计。基于我们的训练集，COSIE纠正95.1％probesets。提供充分和核心集，包括所有链接到成绩单probesets单独的参数文件。我们建议使用下面所列举的研究中也使用了一套核心。


用法----------Usage----------


cosieWrapper()



作者（S）----------Author(s)----------


Gaidatzis et al. Nucleic Acids Research, 2009, 1



参见----------See Also----------

cosieHscore, cosieMmcore, cosieHsfull, cosieMmfull
cosieHscore，cosieMmcore，cosieHsfull，cosieMmfull

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