R语言 OLIN包 mxy2.plot()函数中文帮助文档(中英文对照)

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mxy2.plot(OLIN)
mxy2.plot()所属R语言包：OLIN

                                        Generation of MXY plots based on spot coordinates
                                         基于点坐标代MXY图

                                         译者：生物统计家园网 机器人LoveR

描述----------Description----------

This function produce a MXY plot with a colour bar. In contrast to mxy.plot, the plot is  based on spot coordinates (instead on column and row
此功能用彩条生产1 MXY的图。在对比mxy.plot，图点坐标的基础上（而不是对列和行


用法----------Usage----------


mxy2.plot(V,X,Y,Ngc,Ngr,Nsc,Nsr,color.lim=c(-1,1),xlab="X",ylab="Y",...)



参数----------Arguments----------

参数：V
vector of real values typically logged ratios M.  
实际值向量通常记录比研究


参数：X
vector of x coordinates of spot locations
向量x的坐标点的位置


参数：Y
vector of y coordinates of spot locations
y的坐标点的位置矢量


参数：Ngc
number of columns for the grid matrix
网格矩阵的列数


参数：Ngr
number of rows for the grid matrix
网格矩阵的行数


参数：Nsc
number of columns for the spot matrix
点矩阵的列数


参数：Nsr
number of rows for the spot matrix
点矩阵的行数


参数：color.lim
limits of color range for MXY plot
MXY图色彩范围的限制


参数：xlab
label of x-axis of MXY plot
MXY图x轴的标签


参数：ylab
label of y-axis of MXY plot
MXY图Y轴的标签


参数：...
Further optional graphical parameter for the image function generating the MXY plot
进一步可选参数image函数的图形生成MXY图


Details

详情----------Details----------

The function mxy2.plot can be used to plot the distribution of V across the array. As mxy.plot, it mainly aims for the plotting of the distribution of logged fold changes. It differs from mxy.plot in the representation of spot location. The function mxy.plot uses the index of columns and rows as proxies for the spot location. The gaps between the grid matrices (spotted by different pins) are, therefore, not reproduced in the plot. A more accurate spatial plot is produced by mxy2.plot, which is based on the coordinates of the first column and first raw of the array. Assuming a regular rectangular print layout,
的功能mxy2.plot可以用来绘制V跨阵列分布。 “”mxy.plot，它的主要目的，绘制分布记录的fold change。它不同于mxy.plot点位置的代表性。功能mxy.plot使用索引的列和行作为代理点的位置。因此，网格矩阵（发现不同的引脚）之间的差距，不转载的图。更准确的空间图是由mxy2.plot，这是第一列和第一阵列的原始坐标。假设一个普通的矩形打印布局，


作者（S）----------Author(s)----------


Matthias E. Futschik (<a href="http://itb.biologie.hu-berlin.de/~futschik">http://itb.biologie.hu-berlin.de/~futschik</a>)



参见----------See Also----------

mxy.plot, v2m, m2v, fgbg.visu, image
mxy.plot，v2m，m2v，fgbg.visu，image


举例----------Examples----------


# LOADING DATA[加载数据]
data(sw)
data(sw.xy)
# PLOTTING[图]
mxy2.plot(maM(sw)[,1],X=sw.xy$X[,1],Y=sw.xy$Y[,1], Ngc=maNgc(sw),Ngr=maNgr(sw),
                   Nsc=maNsc(sw),Nsr=maNsr(sw))


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