R语言 OLIN包 backgroundCorrect2()函数中文帮助文档(中英文对照)

loveR

backgroundCorrect2(OLIN)
backgroundCorrect2()所属R语言包：OLIN

                                        Background correction
                                         背景校正

                                         译者：生物统计家园网 机器人LoveR

描述----------Description----------

Background correction based on
基于背景校正


用法----------Usage----------


backgroundCorrect2(object,method="subtract", offset=0)



参数----------Arguments----------

参数：object
object of class marrayRaw  
对象类marrayRaw


参数：method
method for background correction:  “none”, “subtract”, “half”, “minimum”, “movingmin”, “edwards” or “normexp”.  
背景校正：“无”，“减”，“一半”，“最低”，“movingmin”，“爱德华兹”或“normexp”的方法。


参数：offset
numeric value to add to intensities
添加到强度的数值


Details

详情----------Details----------

This function is a wrapper function for backgroundCorrect with following methods implemented:
此功能是用下面的方法实施的backgroundCorrect包装函数：

“none”: no background correction
“无”：无背景校正

“subtract”: simple subtraction of background intensities
“减法”：简单的减法背景强度

“movingmin”: background intensities are first averaged over 3x3 grids of neighbouring spots and subsequently substracted
“movingmin”：背景强度平均3x3的网格相邻点，随后加减

“minimum”: zero or negative intensities after background correction are set equal to half the minimum of positive corrected intensities
“最低”：设置背景校正后的零或负强度等于一半的积极纠正强度最低

“edwards”: background correction based on  log-linear interpolation
“爱德华兹”：基于对数线性插值的背景校正

“normexp”: background correction based on fitting procedure
“normexp”：基于拟合程序的背景校正

For further details and references, please refer to its help page. An alternative Bayesian model for background correction (kooperberg) is also implemented in the limma package.
对于进一步的细节和参考，请参阅其帮助页面。另一种为背景校正贝叶斯模型（kooperberg）limma包实施。


值----------Value----------

Background correct object of class marrayRaw.
背景类marrayRaw正确的对象。


作者（S）----------Author(s)----------


Matthias Futschik



参见----------See Also----------

backgroundCorrect,kooperberg
backgroundCorrect，kooperberg


举例----------Examples----------



# Loading data[数据加载]
data(sw)

#No background correction[没有背景校正]
  sw.none <- backgroundCorrect2(sw,method="none")
  plot(maA(sw.none)[,1],maM(sw.none)[,1])

# Simple subtraction[简单的减法]
  sw.sub <- backgroundCorrect2(sw,method="sub")
  points(maA(sw.sub)[,1],maM(sw.sub)[,1],col="red")


转载请注明:出自 生物统计家园网(http://www.biostatistic.net)。


注：
注1：为了方便大家学习，本文档为生物统计家园网机器人LoveR翻译而成，仅供个人R语言学习参考使用，生物统计家园保留版权。
注2：由于是机器人自动翻译，难免有不准确之处，使用时仔细对照中、英文内容进行反复理解，可以帮助R语言的学习。
注3：如遇到不准确之处，请在本贴的后面进行回帖，我们会逐渐进行修订。