R语言 oligo包 mm()函数中文帮助文档(中英文对照)

loveR

mm(oligo)
mm()所属R语言包：oligo

                                        Accessors and replacement methods for the intensity/PM/MM/BG matrices.
                                         accessor和强度/ / MM /保函矩阵的替代方法。

                                         译者：生物统计家园网 机器人LoveR

描述----------Description----------

Accessors and replacement methods for the PM/MM/BG matrices.
访问器和/ MM /保函矩阵的替代方法。


用法----------Usage----------


intensity(object)
mm(object, subset = NULL)
pm(object, subset = NULL, ...)
bg(object, subset = NULL)
mm(object)<-value
pm(object)<-value
bg(object)<-value



参数----------Arguments----------

参数：object
FeatureSet object.
FeatureSet对象。


参数：subset
Not implemented yet.
尚未实现。


参数：value
matrix object.
matrix对象。


参数：...
Extra arguments for future implementation.
为今后实施额外的参数。


Details

详情----------Details----------

For all objects but TilingFeatureSet, these methods will return matrices. In case of TilingFeatureSet objects, the value is a 3-dimensional array (probes x samples x channels).
对于所有的对象，但TilingFeatureSet，这些方法将返回矩阵。 TilingFeatureSet对象的情况下，该值是一个3维数组（探针x样本x通道）。

intensity will return the whole intensity matrix associated to the object. pm, mm, bg will return the respective PM/MM/BG matrix.
intensity将返回对象关联的整体强度矩阵。 pm，mm，bg将返回各自的PM / MM /保函矩阵。


举例----------Examples----------


if (require(maqcExpression4plex) & require(pd.hg18.60mer.expr)){
xysPath <- system.file("extdata", package="maqcExpression4plex")
xysFiles <- list.xysfiles(xysPath, full.name=TRUE)
ngsExpressionFeatureSet <- read.xysfiles(xysFiles)
pm(ngsExpressionFeatureSet)[1:10,]
}

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注：
注1：为了方便大家学习，本文档为生物统计家园网机器人LoveR翻译而成，仅供个人R语言学习参考使用，生物统计家园保留版权。
注2：由于是机器人自动翻译，难免有不准确之处，使用时仔细对照中、英文内容进行反复理解，可以帮助R语言的学习。
注3：如遇到不准确之处，请在本贴的后面进行回帖，我们会逐渐进行修订。