image(oligo)
image()所属R语言包:oligo
Display a pseudo-image of a microarray chip
显示伪图像的微阵列芯片
译者:生物统计家园网 机器人LoveR
描述----------Description----------
Produces a pseudo-image (graphics::image) for each sample.
产生伪图像(graphics::image)每个样品。
用法----------Usage----------
## S4 method for signature 'FeatureSet'
image(x, which, transfo=log2, ...)
## S4 method for signature 'PLMset'
image(x, which=0,
type=c("weights","resids", "pos.resids","neg.resids","sign.resids"),
use.log=TRUE, add.legend=FALSE, standardize=FALSE,
col=NULL, main, ...)
参数----------Arguments----------
参数:x
FeatureSet object
FeatureSet对象
参数:which
integer indices of samples to be plotted (optional).
整数指数的样本被绘制(可选)。
参数:transfo
function to be applied to the data prior to plotting.
功能被应用到的数据来绘制。
参数:type
Type of statistics to be used.
键入要使用的统计数据。
参数:use.log
Use log.
使用log。
参数:add.legend
Add legend.
新增的传说。
参数:standardize
Standardize residuals.
标准化残差。
参数:col
Colors to be used.
要使用的颜色。
参数:main
Main title.
主标题。
参数:...
parameters to be passed to image
要传递image的参数
举例----------Examples----------
if(require(oligoData) & require(pd.hg18.60mer.expr)){
data(nimbleExpressionFS)
par(mfrow=c(1, 2))
image(nimbleExpressionFS, which=4)
fit <- fitPLM(nimbleExpressionFS)
image(fit, which=4)
}
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注:
注1:为了方便大家学习,本文档为生物统计家园网机器人LoveR翻译而成,仅供个人R语言学习参考使用,生物统计家园保留版权。
注2:由于是机器人自动翻译,难免有不准确之处,使用时仔细对照中、英文内容进行反复理解,可以帮助R语言的学习。
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