hist(oligo)
hist()所属R语言包:oligo
Density estimate
密度估计
译者:生物统计家园网 机器人LoveR
描述----------Description----------
Plot the density estimates for each sample
绘制每个样品的密度估计
用法----------Usage----------
## S4 method for signature 'FeatureSet'
hist(x, transfo=log2, which=c("pm", "mm", "bg", "both", "all"),
nsample=10000, ...)
## S4 method for signature 'ExpressionSet'
hist(x, transfo=identity, nsample=10000, ...)
参数----------Arguments----------
参数:x
FeatureSet or ExpressionSet object
FeatureSet或ExpressionSet对象
参数:transfo
a function to transform the data before plotting. See 'Details'.
改造前的数据绘制的功能。见“详细资料”。
参数:nsample
number of units to sample and build the plot.
单位数目,采样和建立的图。
参数:which
set of probes to be plotted ("pm", "mm", "bg", "both", "all").
探针的设置要绘制(“PM”,“MM”,“BG”,“既”,“所有”)。
参数:...
arguments to be passed to matplot
参数被传递matplot的中
Details
详情----------Details----------
The 'transfo' argument will set the transformation to be used. For raw data, 'transfo=log2' is a common practice. For summarized data (which are often in log2-scale), no transformation is needed (therefore 'transfo=identity').
变换,参数设置要使用的转变。对于原始数据,变换,= log2是一种常见的做法。对于汇总数据(往往以log2规模),没有需要转换(因此变换,=身份“)。
注意----------Note----------
The hist methods for FeatureSet and Expression use a sample (via sample) of the probes/probesets to produce the plot (unless nsample > nrow(x)). Therefore, the user interested in reproducibility is advised to use set.seed.
历史的方法FeatureSet和Expression使用探针/ probesets的一个样本(通过sample)生产图(除非NSample的NROW(X))。因此,在重现感兴趣的用户,建议使用set.seed。
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注:
注1:为了方便大家学习,本文档为生物统计家园网机器人LoveR翻译而成,仅供个人R语言学习参考使用,生物统计家园保留版权。
注2:由于是机器人自动翻译,难免有不准确之处,使用时仔细对照中、英文内容进行反复理解,可以帮助R语言的学习。
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