getNetAffx(oligo)
getNetAffx()所属R语言包:oligo
NetAffx Biological Annotations
NetAffx生物注解
译者:生物统计家园网 机器人LoveR
描述----------Description----------
Gets NetAffx Biological Annotations saved in the annotation package (Exon and Gene ST Affymetrix arrays).
获取生物批注保存在注释包(外显子基因ST Affymetrix公司的阵列)NetAffx。
用法----------Usage----------
getNetAffx(object, type = "probeset")
参数----------Arguments----------
参数:object
'ExpressionSet' object (eg., result of rma())
“ExpressionSet对象(如,RMA的结果())
参数:type
Either 'probeset' or 'transcript', depending on what type of summaries were obtained.
无论是“probeset”或“成绩单”,根据上获得什么类型的摘要。
Details
详情----------Details----------
This retrieves NetAffx annotation saved in the (pd) annotation package - annotation(object). It is only available for Exon ST and Gene ST arrays.
这检索NetAffx注释保存在注释包(PD) - 注释(对象)。这是只适用于外显子,ST和基因ST阵列。
The 'type' argument should match the summarization target used to generate 'object'. The 'rma' method allows for two targets: 'probeset' (target='probeset') and 'transcript' (target='core', target='full', target='extended').
“型”的说法,应该用来生成“对象”的总结目标相匹配。 “RMA”方法允许两个目标:“probeset”(目标=probeset“)和”成绩单“(目标=”核心“,目标=完整,目标=”扩展“)。
值----------Value----------
'AnnotatedDataFrame' that can be used as featureData(object)
的“AnnotatedDataFrame可以作为featureData(对象),用于
作者(S)----------Author(s)----------
Benilton Carvalho
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注:
注1:为了方便大家学习,本文档为生物统计家园网机器人LoveR翻译而成,仅供个人R语言学习参考使用,生物统计家园保留版权。
注2:由于是机器人自动翻译,难免有不准确之处,使用时仔细对照中、英文内容进行反复理解,可以帮助R语言的学习。
注3:如遇到不准确之处,请在本贴的后面进行回帖,我们会逐渐进行修订。
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