R语言 oligoClasses包 RangedData-classes()函数中文帮助文档(中英文对照)

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RangedData-classes(oligoClasses)
RangedData-classes()所属R语言包：oligoClasses

                                        Classes in MinimumDistance for data on ranges
                                         在MinimumDistance类范围上的数据

                                         译者：生物统计家园网 机器人LoveR

描述----------Description----------

RangedDataCNV is a class extending the virtual class RangedDataCopyNumber. RangedDataCopyNumber extends RangedData.
RangedDataCNV是一个类，扩展虚拟类RangedDataCopyNumber。 RangedDataCopyNumber延伸RangedData。

RangedDataCBS extends RangedDataCNV and is useful for storing ranges from segmentation algorithms such as circular binary segmentation.  In particular, the columns 'chrom', 'id', and 'num.mark' are required for instances of the class.
RangedDataCBS延伸RangedDataCNV和存储分割算法，如循环二元分割的范围非常有用。尤其是铬列，身份证，num.mark“需要的类的实例。

RangedDataHMM extends RangedDataHMM and is useful for storing ranges from hidden Markov models such as PennCNV or VanillaICE.  A column labeled 'state' is required for the class.
RangedDataHMM延伸RangedDataHMM“是有用的，用于存储从隐马尔可夫，如PennCNV或VanillaICE的车型范围。标有“国家”一列类的要求。


类的对象----------Objects from the Class----------

See RangedDataCBS and RangedDataHMM constructors.
看到RangedDataCBS和RangedDataHMM构造。


插槽----------Slots----------




ranges: Object of class "RangesList" ~~
ranges：Object类的"RangesList"~~




values: Object of class "SplitDataFrameList" ~~
values：Object类的"SplitDataFrameList"~~




elementType: Object of class "character" ~~
elementType：Object类的"character"~~




elementMetadata: Object of class "DataTableORNULL" ~~
elementMetadata：Object类的"DataTableORNULL"~~




metadata: Object of class "list" ~~
metadata：Object类的"list"~~


延伸----------Extends----------

Class "RangedDataCNV", directly. Class "RangedDataCopyNumber", by class "RangedDataCNV", distance 2.  Class "RangedData", by class "RangedDataCNV", distance 3. Class "DataTable", by class "RangedDataCNV", distance 4. Class "List", by class "RangedDataCNV", distance 4. Class "DataTableORNULL", by class "RangedDataCNV", distance 5. Class "Vector", by class "RangedDataCNV", distance 5. Class "Annotated", by class "RangedDataCNV", distance 6.
类"RangedDataCNV"，直接。类"RangedDataCopyNumber"，类“RangedDataCNV”，距离为2。类"RangedData"，类“RangedDataCNV”，距离3。类"DataTable"，类“RangedDataCNV”，距离4。类"List"，类“RangedDataCNV”，距离4。类"DataTableORNULL"，类“RangedDataCNV”，距离5。类"Vector"，类“RangedDataCNV”，距离5。类"Annotated"，类“RangedDataCNV”，距离6。


方法----------Methods----------




coverage signature(object = "RangedDataCNV"): ...
覆盖signature(object = "RangedDataCNV")：...




state signature(object = "RangedDataCNV"): ...
国家signature(object = "RangedDataCNV")：...




todf signature(object = "RangedDataCNV", range = "ANY"): ...
todfsignature(object = "RangedDataCNV", range = "ANY")...


作者（S）----------Author(s)----------



R. Scharpf




参见----------See Also----------

See RangedData for a detailed description and additional methods.
看到RangedData有详细的说明和额外的方法。


举例----------Examples----------



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