summary.fdr.result(OCplus)
summary.fdr.result()所属R语言包：OCplus
Display functions for local fdr output
显示当地FDR输出功能
译者：生物统计家园网 机器人LoveR
描述----------Description----------
Display functions for output from fdr1d and fdr2d, summarizing the output, displaying the proportion of non-differentially expressed genes and extracting the list of top-regulated genes.
显示输出功能从fdr1d和fdr2d，总结的输出，显示比例非差异表达的基因和提取顶级调节基因的列表。
用法----------Usage----------
summary.fdr.result(object, ...)
p0(x, how = FALSE)
topDE(x, co = 0.1)
参数----------Arguments----------
参数：x, object
an object of class fdr.result created by fdr1d or fdr2d.
类对象fdr.result由fdr1d或fdr2d。
参数：how
a logical value indicating whether to return only the numerical value of the proportion of non-differentially expressed genes, or a list whose second element indicates whether the proportion was estimated from the data or supplied by the user.
一个逻辑值，指明是否返回非差异表达基因的比例数值，或列表的第二个元素表示的比例是否从数据估计，或由用户提供。
参数：...
extra arguments, currently unused
额外的参数，目前未使用
参数：co
cutoff for either FDR or fdr
截止为FDR或FDR
值----------Value----------
For summary.fdr.result, a list with the summary items.
对于summary.fdr.result，汇总项目列表。
For p0, either a numerical value or a list with two elements, depending on the value of parameter how.
p0，无论是数值或列表有两个元素，取决于参数how值。
For topDE, the genes that have FDR (EOC) or fdr (fdr1d, fdr2d) less or equal than co, sorted by FDR or fdr respectively.
topDE，基因有FDR（EOC）或FDR（fdr1d，fdr2d）co，FDR或FDR排序分别小于或等于。
作者（S）----------Author(s)----------
A. Ploner
参见----------See Also----------
fdr1d, fdr2d, EOC
fdr1d，fdr2d，EOC
举例----------Examples----------
# Create object res1d[创建对象res1d]
example(fdr1d)
summary(res1d)
p0(res1d)
p0(res1d, how=TRUE)
topDE(res1d)
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注1：为了方便大家学习，本文档为生物统计家园网机器人LoveR翻译而成，仅供个人R语言学习参考使用，生物统计家园保留版权。
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发表于 2012-2-26 08:03:03
