replaceAboveCutOff(NormqPCR)
replaceAboveCutOff()所属R语言包:NormqPCR
Replace Ct values with new value
Ct值替换为新的价值
译者:生物统计家园网 机器人LoveR
描述----------Description----------
Replace Ct values above a given threshold with a new value
用新值替换一个给定的阈值以上的CT值
用法----------Usage----------
replaceAboveCutOff(qPCRBatch, ...)
## S4 method for signature 'qPCRBatch'
replaceAboveCutOff(qPCRBatch, newVal=NA, cutOff=38)
参数----------Arguments----------
参数:qPCRBatch
Expression set containing qPCR data.
qPCR数据设置的表达。
参数:...
Extra arguments, detailed below
额外的参数,下面详细介绍
参数:newVal
The new value with which to replace the values above the cutoff
新的价值,用以取代高于截止值
参数:cutOff
the minimal threshold above which the values will be replaced
最小阈值高于该值将被替换
Details
详情----------Details----------
Replaces values in the exprs slot of the qPCRBatch object that are above a threshold value with a new number
替换在qPCRBatch对象的exprs插槽上面有一个新的数字阈值的值
值----------Value----------
qPCRBatch object with a new exprs slot
qPCRBatch对象与一个新exprs插槽
作者(S)----------Author(s)----------
James Perkins <a href="mailto:jperkins@biochem.ucl.ac.uk">jperkins@biochem.ucl.ac.uk</a>
举例----------Examples----------
path <- system.file("exData", package = "NormqPCR")
taqman.example <- file.path(path, "example.txt")
qPCRBatch.taqman <- read.taqman(taqman.example)
exprs(qPCRBatch.taqman)["Ccl20.Rn00570287_m1",]
qPCRBatch.taqman.replaced <- replaceAboveCutOff(qPCRBatch.taqman, newVal = NA, cutOff = 35)
exprs(qPCRBatch.taqman.replaced)["Ccl20.Rn00570287_m1",]
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注:
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注2:由于是机器人自动翻译,难免有不准确之处,使用时仔细对照中、英文内容进行反复理解,可以帮助R语言的学习。
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