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R语言 NormqPCR包 combineTechReps()函数中文帮助文档(中英文对照)

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发表于 2012-2-26 07:50:43 | 显示全部楼层 |阅读模式
combineTechReps(NormqPCR)
combineTechReps()所属R语言包:NormqPCR

                                         Combines Technical Replicates
                                         结合技术复制

                                         译者:生物统计家园网 机器人LoveR

描述----------Description----------

Takes expression set of qPCR values containing technical replicates and combines them.
需要表达的定量PCR技术值包含设置复制,并结合他们。


用法----------Usage----------


combineTechReps(qPCRBatch, ...)

## S4 method for signature 'qPCRBatch'
combineTechReps(qPCRBatch, calc="arith")



参数----------Arguments----------

参数:qPCRBatch
Expression set containing qPCR data, read in by a ReadqPCR function and containing technical reps, denoted by _TechRep.n suffix.  
qPCR数据读取,由ReadqPCR功能和含有技术代表,记_TechRep.n后缀表达式设置。


参数:...
Extra arguments, detailed below  
额外的参数,下面详细介绍


参数:calc
use median, arithmetic or geometric mean for combining the values
使用相结合的值中位数,算术或几何平均数


Details

详情----------Details----------

Takes exprs of qPCR values containing technical replicates and combines them using a specified centrality measure.
注意到exprs定量PCR技术值包含复制,并结合使用指定的核心措施。


值----------Value----------

qPCRBatch with same number of samples, but with less features, since all technical replicates are replaced with a single value of their means.
qPCRBatch相同数量的样本,但功能少,复制,因为所有的技术与手段的单一值取代。


作者(S)----------Author(s)----------


James Perkins <a href="mailto:jperkins@biochem.ucl.ac.uk">jperkins@biochem.ucl.ac.uk</a>



举例----------Examples----------


  path <- system.file("exData", package = "NormqPCR")
  qPCR.example.techReps <- file.path(path, "qPCR.techReps.txt")
  qPCRBatch.qPCR.techReps <- read.qPCR(qPCR.example.techReps)
  rownames(exprs(qPCRBatch.qPCR.techReps))
  combinedTechReps <- combineTechReps(qPCRBatch.qPCR.techReps)
  rownames(exprs(combinedTechReps))

转载请注明:出自 生物统计家园网(http://www.biostatistic.net)。


注:
注1:为了方便大家学习,本文档为生物统计家园网机器人LoveR翻译而成,仅供个人R语言学习参考使用,生物统计家园保留版权。
注2:由于是机器人自动翻译,难免有不准确之处,使用时仔细对照中、英文内容进行反复理解,可以帮助R语言的学习。
注3:如遇到不准确之处,请在本贴的后面进行回帖,我们会逐渐进行修订。
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