R语言 NormqPCR包 Colon()函数中文帮助文档(中英文对照)

loveR

Colon(NormqPCR)
Colon()所属R语言包：NormqPCR

                                         Data set of Andersen et al (2004)
                                         安德森等人（2004）数据集

                                         译者：生物统计家园网 机器人LoveR

描述----------Description----------

This data set was used in Andersen et al (2004) to demonstrate normalization  of real-time quantitative RT-PCR data by geometric averaging of housekeeping genes.
该数据集被用来在安德森等人（2004），展示实时定量RT-PCR看家基因的几何平均数据的标准化。


用法----------Usage----------


data(Colon)



格式----------Format----------

A qPCRBatch object which contains an expression matrix with 40 observations on the following 13 variables
一个qPCRBatch对象，其中包含了40以下13个变量的观测表达矩阵




UBC Ubiquitin C.
UBC泛素C。




UBB Ubiquitin B.
UBB泛素B。




SUI1 Putative translation initiation factor.
SUI1假定翻译起始因子。




NACA Nascent-polypeptide-associated complex alpha polypeptide.
NACA新生多肽相关复合阿尔法多肽。




FLJ20030 Hypothetical protein FLJ20030.
FLJ20030假想蛋白FLJ20030。




CFL1 Cofilin 1 (non-muscle).
CFL1cofilin的1（非肌肉）。




ACTB Actin, beta.
ACTB肌动蛋白，β。




CLTC Clathrin, heavy polypeptide (Hc).
CLTC网格，重多肽（HC）。




RPS13 Ribosomal protein S13.
RPS13核糖体蛋白S13。




RPS23 Ribosomal protein S23.
RPS23核糖体蛋白S23。




GAPD Glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase.
GAPD甘油醛-3  - 磷酸脱氢酶。




TPT1 Tumor protein, translationally controlled 1.
TPT1肿瘤蛋白，翻译控制1。




TUBA6 Tubulin alpha 6.
TUBA6微管蛋白的阿尔法6。

It also contains a "group" column in the pData slot, which gives information on the different sample classes, necessary for the NormFinder algorithm
它还包含一个“组”列在PDATA插槽，提供不同的样品类的信息，为必要的NormFinder算法


Details

详情----------Details----------

The genes included in this data set were selected by screening 161 colon  sample expression profiles.
这组数据中所包含的基因筛选161结肠癌样本的表达谱。


源----------Source----------

The data set was obtained from http://www.mdl.dk/Publications_sup1.htm
数据集从http://www.mdl.dk/Publications_sup1.htm获得的


参考文献----------References----------

Normalization of Real-Time Quantitative Reverse Transcription-PCR Data:  A Model-Based Variance Estimation Approach to Identify Genes Suited for Normalization, Applied to Bladder and Colon Cancer Data Sets.  CANCER RESEARCH 64, 5245-5250, August 1, 2004. http://cancerres.aacrjournals.org/cgi/content/full/64/15/5245

举例----------Examples----------


  data(Colon)
  head(exprs(Colon.qPCRBatch))
  pData(Colon.qPCRBatch)

转载请注明:出自 生物统计家园网(http://www.biostatistic.net)。


注：
注1：为了方便大家学习，本文档为生物统计家园网机器人LoveR翻译而成，仅供个人R语言学习参考使用，生物统计家园保留版权。
注2：由于是机器人自动翻译，难免有不准确之处，使用时仔细对照中、英文内容进行反复理解，可以帮助R语言的学习。
注3：如遇到不准确之处，请在本贴的后面进行回帖，我们会逐渐进行修订。