R语言 NormqPCR包 Bladder()函数中文帮助文档(中英文对照)

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Bladder(NormqPCR)
Bladder()所属R语言包：NormqPCR

                                         Data set of Andersen et al (2004)
                                         安德森等人（2004）数据集

                                         译者：生物统计家园网 机器人LoveR

描述----------Description----------

This data set was used in Andersen et al (2004) to demonstrate normalization  of real-time quantitative RT-PCR data by geometric averaging of housekeeping genes.
该数据集被用来在安德森等人（2004），展示实时定量RT-PCR看家基因的几何平均数据的标准化。


用法----------Usage----------


data(Bladder)



格式----------Format----------

A qPCRBatch object which contains an expression matrix with 28 observations on the following 14 variables which stand for  expression data potential reference/housekeeping genes
一个qPCRBatch对象，其中包含了以下14个变量，站在表达数据的潜在参考/管家基因表达矩阵28意见




Grade Grade of bladder cancer.
Grade级膀胱癌。




Sample.no. sample number.
Sample.no.样本数。




ATP5B ATP synthase, H+ transporting, mitochondrial F1 complex, beta polypetide.
ATP5B ATP合成酶，H +的输送，线粒体F1的复杂，β多肽。




HSPCB Heat shock 90-kDa protein 1, beta.
HSPCB热休克90 kDa蛋白，β-1。




S100A6 S100 calcium-binding protein A6 (calcylin).
S100A6 S100钙结合蛋白A6（calcylin）。




FLOT2 Flotillin 2.
FLOT2Flotillin 2。




TEGT Testis enhanced gene transcript (BAX inhibitor 1).
TEGT睾丸增强基因转录（BAX的抑制剂1）。




UBB Ubiquitin B.
UBB泛素B。




TPT1 Tumor protein, translationally controlled 1.
TPT1肿瘤蛋白，翻译控制1。




CFL1 Cofilin 1 (non-muscle).
CFL1cofilin的1（非肌肉）。




ACTB Actin, beta.
ACTB肌动蛋白，β。




RPS13 Ribosomal protein S13.
RPS13核糖体蛋白S13。




RPS23 Ribosomal protein S23.
RPS23核糖体蛋白S23。




GAPD Glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase.
GAPD甘油醛-3  - 磷酸脱氢酶。




UBC Ubiquitin C.
UBC泛素C。




FLJ20030 Hypothetical protein FLJ20030.
FLJ20030假想蛋白FLJ20030。

It also contains a "group" column in the pData slot, which gives information on the different sample classes, necessary for the NormFinder algorithm
它还包含一个“组”列在PDATA插槽，提供不同的样品类的信息，为必要的NormFinder算法


Details

详情----------Details----------

The genes included in this data set were selected by screening 99 bladder  sample expression profiles.
这组数据中所包含的基因筛选99膀胱样本的表达谱。


源----------Source----------

The data set was obtained from http://www.mdl.dk/Publications_sup1.htm
数据集从http://www.mdl.dk/Publications_sup1.htm获得的


参考文献----------References----------

Normalization of Real-Time Quantitative Reverse Transcription-PCR Data:  A Model-Based Variance Estimation Approach to Identify Genes Suited for Normalization, Applied to Bladder and Colon Cancer Data Sets.  CANCER RESEARCH 64, 5245-5250, August 1, 2004. http://cancerres.aacrjournals.org/cgi/content/full/64/15/5245

举例----------Examples----------


  data(Bladder)
  head(exprs(Bladder.qPCRBatch))
  pData(Bladder.qPCRBatch)

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