R语言 nnNorm包 detectSpatialBias()函数中文帮助文档(中英文对照)

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detectSpatialBias(nnNorm)
detectSpatialBias()所属R语言包：nnNorm

                                        Detecting spatial bias within the print-tips of a two channel array
                                         检测空间内的两个通道阵列打印提示偏见

                                         译者：生物统计家园网 机器人LoveR

描述----------Description----------

This function allows to identify in two channel batch of arrays, which are the print-tips where
此功能可以识别两个通道阵列一批，这是打印提示


用法----------Usage----------


detectSpatialBias(mbatch, corThreshold=0.6)



参数----------Arguments----------

参数：mbatch
A marrayRaw or marrayNorm batch of two channel arrays.  
一个marrayRaw或marrayNorm一批双通道阵列。


参数：corThreshold
The correlation treshold to be used.          
要使用相关的传输安全性。


Details

详情----------Details----------

This function computes two matrices: biasRow and biasCol. The elements of these  matrices represent the fraction of rows (columns) for which the correlation coefficient between log-ratios, M, and  column index (row index) is higher than a user specified treshold (default corThreshold=0.6). The idea here is to see in which print-tip a important fraction of the rows (columns) are highly correlated with the  column (row) index. Since some rows (columns) will show positive correlation while the other negative correlation, we  are only interested in a sigle direction of the correlation, i.e. either positive or negative.
此函数计算两个矩阵：biasRow和biasCol。这些矩阵中的元素，代表了部分行（列）数比率，男，列索引（行索引）之间的相关系数高于用户指定的传输安全性（默认corThreshold = 0.6）。这里的想法是要看到，在打印头的行（列）的重要部分列（行）指数高度相关。由于一些行（列）将显示呈正相关，而其他的负相关关系，我们只事务所在相关方向感兴趣，即无论是积极或消极的。


值----------Value----------

This function returns a list with two matrices. biasRow and biasCol. The rows of these matrices correspond to the print tips counted metaRow wise, and the columns correspond to arrays. Values in these matrices superior to 33  point to print-tips that have more tha a third of the rows (columns) with important spatial bias.  
此函数返回一个列表，两个矩阵。 biasRow和biasCol。这些矩阵的行对应的打印计数metaRow明智的技巧，和列对应数组。这些矩阵值高于33点打印提示，有更多的临屋区的一个重要的空间偏见的行（列）第三。


作者（S）----------Author(s)----------


Tarca, A.L.



参考文献----------References----------

Adi. L. Tarca , Janice. E. K. Cooke, and John Mackay, Bioinformatics, 21, 2005, 2674 - 2683.<br>

参见----------See Also----------

maNormNN
maNormNN


举例----------Examples----------


# detecting spatial bias in swirl data[检测漩涡数据空间偏见]
data(swirl)
# print-tip, intensity and spatial normalization of the first slide in swirl data set[打印头，强度和空间标准化的漩涡数据集的第一张幻灯片]
myres<-detectSpatialBias(swirl)   

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