R语言 nem包 getDensityMatrix()函数中文帮助文档(中英文对照)

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getDensityMatrix(nem)
getDensityMatrix()所属R语言包：nem

                                        Calculate density matrix from raw p-value matrix
                                         从原材料的P-值矩阵计算密度矩阵

                                         译者：生物统计家园网 机器人LoveR

描述----------Description----------

Fit a 3 component BUM model to each column of a raw p-value matrix.
3组件多层板模型适合原始的p值矩阵的每一列。


用法----------Usage----------


        getDensityMatrix(Porig, dirname=NULL, startab=c(0.3,10), startlam=c(0.6,0.1,0.3), tol=1e-4)



参数----------Arguments----------

参数：Porig
matrix of raw p-values
原料p值矩阵


参数：dirname
name of a directory to save histograms and QQ-plots to. If dirname=NULL, then the plots are made to the screen, and after each fit the user is asked to press a key in order to continue.
目录的名称保存直方图和QQ的图来。如果目录名称= NULL，那么图的屏幕，并在每个适合用户要求按一个键以继续。


参数：startab
start values for alpha and beta parameter
启动α和β参数值


参数：startlam
start values for mixing coefficients
启动混合系数的值


参数：tol
convergence tolerance: If the absolute likelihood ratio -1 becomes smaller than this value, then the EM algorithm is supposed to be converged.
收敛公差：如果绝对的可能性比-1小于这个值，那么EM算法应该是融合。


Details

详情----------Details----------

The BUM density model consists of 3 components: f(x) = lambda_1 + lambda_2*dbeta(x,alpha,1) + lambda_3*dbeta(x,1,beta). The mixing coefficients and the parameters alpha and beta are fitted together via an EM algorithm.
流浪汉密度模型由3部分组成：f(x) = lambda_1 + lambda_2*dbeta(x,alpha,1) + lambda_3*dbeta(x,1,beta)。混合系数和参数α和β都配在一起通过EM算法。


值----------Value----------

log-density matrix of same dimensions as Porig: The log-densities can be interpreted as log signal-to-noise ratios. A value > 0 means higher signal than noise, and a value < 0 a higher noise than signal.
记录密度矩阵像Porig尺寸相同：记录密度可以解释为log信号信噪比。 A值> 0意味着更高的信号噪声，和值<0比更高的噪声信号。


注意----------Note----------

Note the difference to the previous package version: the LOG-density is returned now!
注意：以前的包版的区别：现在返回LOG密度！


作者（S）----------Author(s)----------


Holger Froehlich

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注：
注1：为了方便大家学习，本文档为生物统计家园网机器人LoveR翻译而成，仅供个人R语言学习参考使用，生物统计家园保留版权。
注2：由于是机器人自动翻译，难免有不准确之处，使用时仔细对照中、英文内容进行反复理解，可以帮助R语言的学习。
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