R语言 nem包 enumerate.models()函数中文帮助文档(中英文对照)

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enumerate.models(nem)
enumerate.models()所属R语言包：nem

                                        Exhaustive enumeration of models
                                         详尽列举的车型

                                         译者：生物统计家园网 机器人LoveR

描述----------Description----------

The function enumerate.models is used to create the model space for inference by exhaustive enumeration.  It computes a list of all transitively closed directed graphs on a given number of nodes.
的功能enumerate.models被用来创建模型空间推理详尽列举。它计算所有传递封闭定向图表上给定数量的节点列表。


用法----------Usage----------


enumerate.models(x,name=NULL,trans.close=TRUE,verbose=TRUE)



参数----------Arguments----------

参数：x
either the number of nodes or a vector of node names.
无论是数量的节点或节点名称的向量。


参数：name
optionally the nodenames, if they are not provided in x
可选的节点名，如果他们没有在x


参数：trans.close
should graphs be transitively closed?
图应该是传递关闭？


参数：verbose
if TRUE outputs number of (unique) models. Default: TRUE
如果真正的产出数量（唯一）模型。默认：true


Details

详情----------Details----------

The model space of Nested Effects Models consists of all transitively closed directed graphs.  The function enumerate.models creates them in three steps: (1.) build all directed graphs on x (or length(x)) nodes, (2.) transitively close each one of them, and (3.) remove redundant models to yield a unique set. So far, enumeration is limited to up to 5 nodes.
嵌套效应模型的模型空间包括所有传递封闭的指示图。功能enumerate.models创建三个步骤：（1）建立x（或length(x)）节点，（2）逐一传递关闭，（有向图3）删除多余的模型来产生一个独特的一套。到目前为止，枚举仅限于高达5个节点。

I'm aware that this is inefficient!  It would be very desirable to enumerate the models directly (i.e. without creating all directed graphs as an intermediate step).
我知道，这是低效的！直接列举的车型（即不作为一个中间步骤中创建的所有指示图），这将是非常可取的。


值----------Value----------

a list of models. Each entry is a transitively closed adjacency matrix with unit main diagonal.
一个车型的名单。每个条目是一个单位的主对角线传递封闭的邻接矩阵。


作者（S）----------Author(s)----------


Florian Markowetz <URL: http://genomics.princeton.edu/~florian>



参见----------See Also----------

nem
nem


举例----------Examples----------


enumerate.models(2)
enumerate.models(c("Anna","Bert"))

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