R语言 multtest包 mt.reject()函数中文帮助文档(中英文对照)

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mt.reject(multtest)
mt.reject()所属R语言包：multtest

                                        Identity and number of rejected hypotheses
                                         拒绝假说的身份和数量

                                         译者：生物统计家园网 机器人LoveR

描述----------Description----------

This function returns the identity and number of rejected hypotheses for several multiple testing procedures and different nominal Type I error rates.
这个函数返回多个测试程序和不同面值的I型错误率拒绝假说的身份和数量。


用法----------Usage----------


mt.reject(adjp, alpha)



参数----------Arguments----------

参数：adjp
A matrix of adjusted p-values, with rows corresponding to hypotheses and columns to multiple testing procedures. This matrix could be obtained from the function mt.rawp2adjp .
一，调整后的P-值矩阵，行相应的假设和列多个测试程序。这个矩阵可以得到从功能mt.rawp2adjp。


参数：alpha
A vector of nominal Type I error rates.
名义I型错误率的向量。


值----------Value----------

A list with components
与组件列表


参数：r
A matrix containing the number of rejected hypotheses for several multiple testing procedures and different nominal Type I error rates. Rows correspond to Type I error rates and columns to multiple testing procedures.
矩阵包含几多个测试程序和不同面值的I型错误率拒绝假设。行对应多个测试程序，键入我的错误率和列。


参数：which
A matrix of indicators for the rejection of individual hypotheses by different multiple testing procedures for a nominal Type I error rate alpha[1]. Rows correspond to hypotheses and columns to multiple testing procedures.
一个由多个测试程序，不同的标称类型错误率alpha[1]矩阵拒绝个别假设的指标。行对应多个测试程序的假设和列。


作者（S）----------Author(s)----------



Sandrine Dudoit,  <a href="http://www.stat.berkeley.edu/~sandrine">http://www.stat.berkeley.edu/~sandrine</a>, <br>
Yongchao Ge, <a href="mailto:yongchao.ge@mssm.edu">yongchao.ge@mssm.edu</a>.




参见----------See Also----------

mt.maxT, mt.minP, mt.rawp2adjp, golub.
mt.maxT，mt.minP，mt.rawp2adjp，golub。


举例----------Examples----------


# Gene expression data from Golub et al. (1999)[Golub等基因表达数据。 （1999）]
# To reduce computation time and for illustrative purposes, we condider only[为了减少计算时间，并说明目的，我们只condider]
# the first 100 genes and use the default of B=10,000 permutations.[第100个基因，并使用默认的B =万排列。]
# In general, one would need a much larger number of permutations[在一般情况下，将需要一个更大的数目排列]
# for microarray data.[微阵列数据。]

data(golub)
smallgd<-golub[1:100,]
classlabel<-golub.cl

# Permutation unadjusted p-values and adjusted p-values for maxT procedure[未经调整的置换P-值和p值调整maxT过程]
res<-mt.maxT(smallgd,classlabel)
mt.reject(cbind(res$rawp,res$adjp),seq(0,1,0.1))$r


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