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R语言 MSnbase包 plotDensity-methods()函数中文帮助文档(中英文对照)

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发表于 2012-2-26 01:13:27 | 显示全部楼层 |阅读模式
plotDensity-methods(MSnbase)
plotDensity-methods()所属R语言包:MSnbase

                                        The 'plotDensity' method for 'MSnExp' quality assessment
                                         “plotDensity”为MSnExp质量评估方法

                                         译者:生物统计家园网 机器人LoveR

描述----------Description----------

These methods plot the distribution of several parameters of interest for the different precursor charges for "MSnExp" experiment.
这些方法的图"MSnExp"实验不同的易制毒化学收费利益分配几个参数。

The methods make use the ggplot2 system. An object of class 'ggplot' is returned invisibly.
该方法使使用ggplot2系统。返回无形一个类的ggplot“的对象。


参数----------Arguments----------

参数:object
An object of class "MSnExp" or and 'data.frame'. In the latter case, the data frame must have numerical columns named 'charge' and one of 'precursor.mz', 'peaks.count' or 'tic', depending on the z parameter. Such a data frame is typically generated using the header method on "MSnExp" object.  
类"MSnExp"和“数据框”的对象。在后一种情况下,数据框必须有名为充电和一个“precursor.mz,peaks.count”或“抽动”的数值列,取决于z参数。这样一个数据框通常使用header方法"MSnExp"对象。


参数:z
A character indicating which parameter's densitiy to plot. One of, possibly abreviated, "tic" (total ion count), "peaks.count" (peaks count) or "precursor.mz" (precursor MZ).   
字符显示哪个参数是densitiy的绘图。其一,可能是缩写为“TIC”(总离子数),“peaks.count”(山峰计数)或的“precursor.mz”(易制毒化学锰锌)。


参数:log
Logical, whether to log transform the data (default is 'FALSE').   
逻辑,是否记录转换数据(默认是“假”)。


参数:plot
A logical indicating whether the plot should be printed (default is 'TRUE').  
一个逻辑图是否应印(默认为“真”)。


方法----------Methods----------

Plots a 'MSnExp' summary.
绘制MSnExp“总结。

Plots a summary of the 'MSnExp' experiment described by the data frame.
图汇总数据框所描述的MSnExp“实验。


作者(S)----------Author(s)----------



Laurent Gatto <lg390@cam.ac.uk>




参见----------See Also----------

The plot2d and plotDensity methods for other QC plots.
plot2d和plotDensity其他质控图的方法。


举例----------Examples----------


itraqdata
plotDensity(itraqdata,z="tic")
plotDensity(itraqdata,z="peaks.count")
plotDensity(itraqdata,z="precursor.mz")

转载请注明:出自 生物统计家园网(http://www.biostatistic.net)。


注:
注1:为了方便大家学习,本文档为生物统计家园网机器人LoveR翻译而成,仅供个人R语言学习参考使用,生物统计家园保留版权。
注2:由于是机器人自动翻译,难免有不准确之处,使用时仔细对照中、英文内容进行反复理解,可以帮助R语言的学习。
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