itraqdata(MSnbase)
itraqdata()所属R语言包:MSnbase
Example MSnExp data set
例如MSnExp数据集
译者:生物统计家园网 机器人LoveR
描述----------Description----------
This example data sets is an iTRAQ 4-plex experiment that has been run on an Orbitrap Velos instrument. It includes identification data in the feature data slot obtain from the Mascot search engine.
这个例子中的数据集是Orbitrap Velos的仪器已运行iTRAQ的4复杂的实验。它包括识别数据中的特征数据插槽获得吉祥物的搜索引擎。
itraqdata is a subset of an spike-in experiment where proteins have spiked in an Erwinia background, as described in Karp et al. (2010), Addressing accuracy and precision issues in iTRAQ quantitation, Mol Cell Proteomics. 2010 Sep;9(9):1885-97. Epub 2010 Apr 10. (PMID 20382981). The spiked-in proteins in itradata are BSA and ENO and are present in relative abundances 1, 2.5, 5, 10 and 10, 5, 2.5, 1 in the 114, 115, 116 and 117 reporter tags.
itraqdata是一个子集穗实验蛋白质在欧文背景飙升,卡普等。 (2010年),处理的准确性和精度问题iTRAQ的定量分析,单元蛋白质组学研究。 2010 09 9(9):1885-97。 04月10日出处2010。 (显示20382981)。 itradata钉在蛋白质BSA和ENO,在目前的相对丰度1,2.5,5,10和10,5,2.5,1 114,115,116和117的记者标签。
This example data set is used in the MSnbase-demo vignette, available with vignette("MSnbase-demo",package="MSnbase").
本示例数据集使用的MSnbase演示的小插曲,vignette("MSnbase-demo",package="MSnbase")。
用法----------Usage----------
itraqdata
举例----------Examples----------
itraqdata
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