R语言 MSnbase包 iTRAQ4()函数中文帮助文档(中英文对照)

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iTRAQ4(MSnbase)
iTRAQ4()所属R语言包：MSnbase

                                         iTRAQ 4-plex set
                                         iTRAQ的4丛集

                                         译者：生物统计家园网 机器人LoveR

描述----------Description----------

This instance of class "ReporterIons" corresponds to the iTRAQ 4-plex set, i.e the 114, 115, 116 and 117 isobaric tags. In the iTRAQ5 data set, an unfragmented tag, i.e reporter and attached isobaric tag, is also included at MZ 145. These objects are used to plot the reporter ions of interest in an MSMS spectra (see "Spectrum2") as well as for quantification (see quantify).
这"ReporterIons"类的实例对应的iTRAQ的一套4复杂，即114，115，116和117等压标记。在iTRAQ5数据集，不分段标记，即记者和附加等压标记，也包括在锰锌145。这些对象用于绘制在MSMS光谱记者感兴趣的离子（见"Spectrum2"）以及量化（见quantify）。


用法----------Usage----------


iTRAQ4
iTRAQ5
iTRAQ8
iTRAQ9



参考文献----------References----------

Khainovski N, Pillai S, Dey S, Daniels S, Purkayastha S, Juhasz P, Martin S, Bartlet-Jones M, He F, Jacobson A, Pappin DJ. "Multiplexed protein quantitation in Saccharomyces cerevisiae using amine-reactive isobaric tagging reagents." Mol Cell Proteomics, 2004 Dec;3(12):1154-69. Epub 2004 Sep 22. PubMed PMID: 15385600.

参见----------See Also----------

TMT6.
TMT6。


举例----------Examples----------


iTRAQ4
iTRAQ4[1:2]

newReporter <- new("ReporterIons",
                   description="an example",
                   name="my reporter ions",
                   reporterNames=c("myrep1","myrep2"),
                   mz=c(121,122),
                   col=c("red","blue"),
                   width=0.05)
newReporter

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