R语言 MotIV包 trimPWMedge()函数中文帮助文档(中英文对照)

loveR

trimPWMedge(MotIV)
trimPWMedge()所属R语言包：MotIV

                                        Trim PWM edge
                                         修剪PWM边沿

                                         译者：生物统计家园网 机器人LoveR

描述----------Description----------

This function is use to cut edges with low information content.
此功能是利用削减信息含量低的边缘。


用法----------Usage----------


  trimPWMedge(x, threshold=1)



参数----------Arguments----------

参数：x
A matrix representing a PWM.
一个矩阵代表一个PWM。


参数：threshold
A transcription factor name or a list of TF names.
转录因子的名称或TF的名称列表。


值----------Value----------

A PWM.
APWM。


作者（S）----------Author(s)----------


Eloi Mercier &lt;<a href="mailto:emercier@chibi.ubc.ca">emercier@chibi.ubc.ca</a>&gt;



参见----------See Also----------

makePWM
makePWM


举例----------Examples----------


#####Database and Scores#####[＃＃＃＃数据库和成绩＃＃＃＃＃]
path <- system.file(package="MotIV")
jaspar <- readPWMfile(paste(path,"/extdata/jaspar2010.txt",sep=""))
jaspar.scores <- readDBScores(paste(path,"/extdata/jaspar2010_PCC_SWU.scores",sep=""))

#####Input#####[＃＃＃＃输入＃＃＃＃＃]
data(FOXA1_rGADEM)
motifs <- getPWM(gadem)
motifs.trimed <- trimPWMedge(motifs, threshold=1)

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注：
注1：为了方便大家学习，本文档为生物统计家园网机器人LoveR翻译而成，仅供个人R语言学习参考使用，生物统计家园保留版权。
注2：由于是机器人自动翻译，难免有不准确之处，使用时仔细对照中、英文内容进行反复理解，可以帮助R语言的学习。
注3：如遇到不准确之处，请在本贴的后面进行回帖，我们会逐渐进行修订。