R语言 MmPalateMiRNA包 filterArray()函数中文帮助文档(中英文对照)

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filterArray(MmPalateMiRNA)
filterArray()所属R语言包：MmPalateMiRNA

                                         Filter an <a href="../../limma/html/RGList%2dclass.html">RGList</a> object to remove probes
                                         过滤的<a href="../../limma/html/RGList%2dclass.html"> RGList </ a>对象删除探针

                                         译者：生物统计家园网 机器人LoveR

描述----------Description----------

Filters an RGList object to remove probes with foreground  intensities not sufficiently above the background intensity. Additionally can filter probes based on character strings, to remove e.g. control probes.  
RGList对象去除探针与前景强度不够的背景强度以上的过滤器。此外可以过滤基于字符串的探针，以消除如控制探针。


用法----------Usage----------


filterArray (obj, ...)
## S4 method for signature 'RGList'
filterArray(obj, keep, frac, number, reps)



参数----------Arguments----------

参数：obj
An RGList object  
RGList对象


参数：keep
Character vector to be used as a text filter. Only gene names (as contained in obj$genes$Name) which contain these text strings will be retained.   
特征向量被用来作为一个文本过滤器。唯一的基因名称（载obj$genes$Name的），其中包含这些文本串将被保留。


参数：frac
Fraction to use as a background filter.  Only those probes with foreground values (both red and green) greater than 'frac' times the background  values pass the filter.  
分数作为背景的过滤器使用。只有那些与前景值（红色和绿色）大于“压裂”的时代背景值，通过过滤器的探针。


参数：number
The number of samples required to pass the background filter for each probe.   
必须通过为每个探针的背景过滤的样品数。


参数：reps
The number of replicates for each probe required to pass the filtering step.  
复制需要通过过滤步骤每个探针的数量。


参数：...
allows additional arguments to be passed to specific methods  
允许额外的参数被传递到具体的方法


值----------Value----------

Returns an RGList object identical in structure to the input  object, but with reduced dimension according to the filtering steps.
返回一个RGList对象结构相同的输入对象，但根据降维的过滤步骤。


方法----------Methods----------


参见----------See Also----------

checkMVs,  fixMVs, checkOutliers, fixOutliers
checkMVs，fixMVs，checkOutliers，fixOutliers


举例----------Examples----------


data(PalateData)
reducedSet <- filterArray(PalateData, keep=c("MIR", "LET", "POSCON", "CALIB"),
                          frac=1.1, number=3, reps=4)

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