clustPlot(MmPalateMiRNA)
clustPlot()所属R语言包:MmPalateMiRNA
Plot expression profiles
图表达概况
译者:生物统计家园网 机器人LoveR
描述----------Description----------
Produces plots of clustered expression profiles, with seperate plots for each cluster. The average expression profile for each cluster is superimposed as well.
产生聚集的表达谱的图,与单独的图为每个聚类。平均每个聚类的表达谱以及叠加。
用法----------Usage----------
clustPlot(cl, mat, nrow, ncol)
参数----------Arguments----------
参数:cl
integer vector giving the cluster membership for each item
给每个项目的聚类成员的整数向量
参数:mat
matrix of values to be plotted
要绘制的数值矩阵
参数:nrow
number of rows to use for plotting
使用绘图的行数
参数:ncol
number of columns to use for plotting
列数使用的图
Details
详情----------Details----------
The figure region will be subdivided into nrow by ncol separate plots, using mfrow. The average expression profile and the number of genes belonging to each cluster is superimposed on each of the plots.
图区域将被划分成nrowncol单独的图,使用mfrow。对每个图的平均表达谱和属于每个簇的基因数目是叠加。
参考文献----------References----------
clValid, an R package for cluster validation. Journal of Statistical Software, 25, 2008.
参见----------See Also----------
See the package vignette for illustration on usage
看到包在使用上的插图小品文
举例----------Examples----------
## generate some fake data and cluster[#产生一些假数据和聚类]
set.seed(101)
mat <- matrix(rnorm(500), nrow=100, ncol=5)
clusts <- hclust(dist(mat))
cl <- cutree(clusts, 6)
clustPlot(cl, mat, 3, 2)
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注:
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注2:由于是机器人自动翻译,难免有不准确之处,使用时仔细对照中、英文内容进行反复理解,可以帮助R语言的学习。
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