addGeneSetDescription(MLP)
addGeneSetDescription()所属R语言包:MLP
Utility function which adds the biological description of the gene sets as...
增加了生物的基因描述的效用函数设定为...
译者:生物统计家园网 机器人LoveR
描述----------Description----------
Utility function which adds the biological description of the gene sets as
它增加了生物的基因描述的效用函数设定为
用法----------Usage----------
参数----------Arguments----------
参数:object
object of class 'MLP' as produced by the 'MLP' function
“总纲发展蓝图”功能类的MLP作为生产对象
参数:geneSetSource
source to be used to construct the list of pathway categories; for public data sources, the user can specify a string (one of 'GOBP', 'GOMF', 'GOCC', 'KEGG' or 'REACTOME') and BioC packages will be used to construct the list of pathway categories; for non-public data sources, the user can pass the pathway data as a dataframe with (at least) the following four columns: PATHWAYID, TAXID, PATHWAYNAME and GENEID. It is assumed all columns are of type character. The 'geneSetSource' argument should be the same as the argument provided to the getGeneSets function; defaults to NULL
源被用来兴建的通路类别的列表;公共数据源,用户可以指定一个字符串之一GOBP,GOMF“,,GOCC”,“KEGG或REACTOME,BioC包会被用来构造的途径类别的列表;非公开的数据源,用户可以通过以下四个列(至少)作为一个dataframe的途径数据:PATHWAYID,TAXID,PATHWAYNAME和GENEID。这是假设所有列的字符类型。 geneSetSource的说法应该是相同的作为提供getGeneSets功能参数,默认为NULL
值----------Value----------
the data frame as returned by MLP enriched with an additional column geneSetDescription, providing
数据框与附加列geneSetDescription,提供丰富的MLP返回
参见----------See Also----------
MLP
总纲发展蓝图
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注:
注1:为了方便大家学习,本文档为生物统计家园网机器人LoveR翻译而成,仅供个人R语言学习参考使用,生物统计家园保留版权。
注2:由于是机器人自动翻译,难免有不准确之处,使用时仔细对照中、英文内容进行反复理解,可以帮助R语言的学习。
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