R语言 minfi包 RGChannelSet-class()函数中文帮助文档(中英文对照)

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RGChannelSet-class(minfi)
RGChannelSet-class()所属R语言包：minfi

                                        Class "RGChannelSet"
                                         类“RGChannelSet”

                                         译者：生物统计家园网 机器人LoveR

描述----------Description----------

These classes represents raw (unprocessed) data from a two color micro array; specifically an Illumina methylation array.
这些类代表从两种颜色微阵列原料（原粮）的数据，特别是Illumina的甲基化阵列。


类的对象----------Objects from the Class----------

Objects can be created by calls of the form new("RGChannelSet",   Red, Green, ...) or new("RGChannelSetExtended", Red, Green, RedSD, GreenSD, NBeads, ...).
对象可以创建的形式new("RGChannelSet",   Red, Green, ...)或new("RGChannelSetExtended", Red, Green, RedSD, GreenSD, NBeads, ...)的检测。


插槽----------Slots----------




assayData: Object of class "AssayData".  A RGChannelSet contains elements with names Green and Red and a "RGChannelSetExtended" additionally adds
assayData类"AssayData"的对象。一个RGChannelSet名Green和Red“"RGChannelSetExtended"额外添加元素




phenoData: Object of class "AnnotatedDataFrame".
phenoData类"AnnotatedDataFrame"的对象。




featureData: Object of class "AnnotatedDataFrame".
featureData类"AnnotatedDataFrame"的对象。




experimentData: Object of class "MIAxE".
experimentData类"MIAxE"的对象。




annotation: Object of class "character".
annotation类"character"的对象。




protocolData: Object of class "AnnotatedDataFrame".
protocolData类"AnnotatedDataFrame"的对象。




.__classVersion__: Object of class "Versions".
.__classVersion__类"Versions"的对象。


延伸----------Extends----------

Class "eSet", directly. Class "VersionedBiobase", by class "eSet", distance 2. Class "Versioned", by class "eSet", distance 3.
类"eSet"，直接。类"VersionedBiobase"类"eSet"，距离2。类"Versioned"类"eSet"，距离3。


公用事业----------Utilities----------




show: The show method.
show：Show方法。




initialize: The initialize method, see above.
initialize：initialize方法，见上面。




getGreen: Gets the Green channel as a matrix.
getGreen：获取作为一个矩阵的绿色通道。




getRed: Gets the Red channel as a matrix.
getRed：获取作为基质的红色通道。




getManifest: Gets the manifest object associated with
getManifest：获取对象与列表


作者（S）----------Author(s)----------



Kasper Daniel Hansen <a href="mailto:khansen@jhsph.edu">khansen@jhsph.edu</a>.




参见----------See Also----------

See eSet for the basic class that is used as a building block for "RGChannelSet(Extended)".  See IlluminaMethylationManifest for a class representing the design of the array.
看到eSet作为"RGChannelSet(Extended)"积木为基本类。看到IlluminaMethylationManifest一类代表阵列的设计。


举例----------Examples----------


showClass("RGChannelSet")

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注：
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