workedExampleNotNormalizedData(MiChip)
workedExampleNotNormalizedData()所属R语言包:MiChip
Worked Example of MiChip Processing
样例MiChip处理
译者:生物统计家园网 机器人LoveR
描述----------Description----------
Loads a set of hybridizations into a matrix and them proceeds to filter and summarize these data
加载成一个矩阵杂交,和他们进行过滤和总结这些数据
用法----------Usage----------
workedExampleNotNormalizedData(exptname, intensityCutoff=0, datadir=".", minSumlength, madAdjust = FALSE )
参数----------Arguments----------
参数:exptname
string indicating the name of the experiment
实验的名称的字符串,指示
参数:intensityCutoff
The intensity value for accepting the spots intensity value in the experment
为接受在experment的点强度值的强度值
参数:datadir
The directory contain data from the experiment
该目录包含从实验数据
参数:minSumlength
Minimum exceptable number of values to summarize intensity value.
最低exceptable数量值来概括强度值。
参数:madAdjust
if TRUE then summarized data will be filtered according to the MAD median absolute deviation and set to NA if the median is less than MAD
如果TRUE然后汇总数据将被过滤疯狂的中位数绝对偏差设置NA如果中位数是比狂热
举例----------Examples----------
#Summarizes the data in the current directory [总结了当前目录中的数据]
## Not run: [#无法运行:]
mySummarizedEset <-workedExampleNotNormalizedData("MyExpt", intensityCutoff=0, datadir=".", minSumlength=0, madAdjust=TRUE)
## End(Not run)[#结束(不运行)]
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注:
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