R语言 MiChip包 workedExampleMedianNormalize()函数中文帮助文档(中英文对照)

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workedExampleMedianNormalize(MiChip)
workedExampleMedianNormalize()所属R语言包：MiChip

                                        Worked Example of MiChip Processing
                                         样例MiChip处理

                                         译者：生物统计家园网 机器人LoveR

描述----------Description----------

Loads a set of hybridizations into a matrix and them proceeds to filter, summarize and  median normalize them
加载成一个矩阵杂交，他们的收益进行筛选，汇总和中位数标准化他们


用法----------Usage----------


workedExampleMedianNormalize(exptname, intensityCutoff=0, datadir=".", minSumlength, madAdjust = FALSE)



参数----------Arguments----------

参数：exptname
string indicating the name of the experiment
实验的名称的字符串，指示


参数：intensityCutoff
The intensity value for accepting the spots intensity value in the experiment
接受实验点的强度值的强度值


参数：datadir
The directory where hybridization files are found.
杂交文件所在的目录被发现。


参数：minSumlength
Minimum exceptable number of values to summarize intensity value.
最低exceptable数量值来概括强度值。


参数：madAdjust
if TRUE then summarized data will be filtered according to the MAD median absolute deviation and set to  NA if the median is less than MAD
如果TRUE然后汇总数据将被过滤疯狂的中位数绝对偏差设置NA如果中位数是比狂热


举例----------Examples----------


#Normalize data in the current directory to the median per chip[每块芯片的中位数在当前目录中的数据标准化]
datadir <- system.file("extdata", package="MiChip")
myNormedEset <-workedExampleMedianNormalize("MyExpt", intensityCutoff=0, datadir, minSumlength=0, madAdjust=TRUE)

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注：
注1：为了方便大家学习，本文档为生物统计家园网机器人LoveR翻译而成，仅供个人R语言学习参考使用，生物统计家园保留版权。
注2：由于是机器人自动翻译，难免有不准确之处，使用时仔细对照中、英文内容进行反复理解，可以帮助R语言的学习。
注3：如遇到不准确之处，请在本贴的后面进行回帖，我们会逐渐进行修订。