R语言 Mfuzz包 overlap()函数中文帮助文档(中英文对照)

loveR

overlap(Mfuzz)
overlap()所属R语言包：Mfuzz

                                        Calculation of the overlap of soft clusters
                                         软聚类的重叠计算

                                         译者：生物统计家园网 机器人LoveR

描述----------Description----------

This function calculates  the overlap of clusters
此函数计算聚类的重叠


用法----------Usage----------


overlap(cl)



参数----------Arguments----------

参数：cl
object of class flclust          
对象的类flclust


值----------Value----------

The function generates a matrix of the  normalised overlap of soft clusters. The overlap indicates the extent of “shared” genes between clusters. For a mathematical definiton of the overlap, see the vignette
该函数产生一个软聚类归重叠矩阵。重叠表示程度的“共享”聚类之间的基因。对于一个数学definiton重叠，看到的小插曲


作者（S）----------Author(s)----------


Matthias E. Futschik  (<a href="http://itb.biologie.hu-berlin.de/~futschik">http://itb.biologie.hu-berlin.de/~futschik</a>)



参考文献----------References----------

gene expression time-course data, Journal of Bioinformatics and

举例----------Examples----------


if (interactive()){
data(yeast)
# Data pre-processing[数据预处理]
yeastF <- filter.NA(yeast)
yeastF <- fill.NA(yeastF)
yeastF <- standardise(yeastF)

# Soft clustering and visualisation[软聚类和可视化]
cl <- mfuzz(yeastF,c=20,m=1.25)
mfuzz.plot(yeastF,cl=cl,mfrow=c(4,5))

# Calculation of cluster overlap and visualisation [聚类重叠和可视化计算]
O <- overlap(cl)
X11()
Ptmp <- overlap.plot(cl,over=O,thres=0.05)
}

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注：
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注2：由于是机器人自动翻译，难免有不准确之处，使用时仔细对照中、英文内容进行反复理解，可以帮助R语言的学习。
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