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R语言 Mfuzz包 Mfuzzgui()函数中文帮助文档(中英文对照)

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发表于 2012-2-26 00:48:53 | 显示全部楼层 |阅读模式
Mfuzzgui(Mfuzz)
Mfuzzgui()所属R语言包:Mfuzz

                                        Graphical user interface for Mfuzz package
                                         Mfuzz包的图形用户界面

                                         译者:生物统计家园网 机器人LoveR

描述----------Description----------

The function Mfuzzgui provides a graphical user interface for clustering of microarray data and visualisation of results. It is based on the functions of the Mfuzz package.
功能Mfuzzgui提供一个聚类的微阵列数据和结果的可视化的图形用户界面。它是基于的Mfuzz包的功能。


用法----------Usage----------


Mfuzzgui()



Details

详情----------Details----------

The function Mfuzzgui launches a graphical user interface for the Mfuzz package. It is based on Tk widgets using the R TclTk interface by Peter Dalgaard. It also employs some pre-made widgets from the tkWidgets Bioconductor-package by Jianhua Zhang for the selection of objects/files to be loaded.
函数Mfuzzgui启动一个为Mfuzz包的图形用户界面。它是基于Tk的使用由彼得Dalgaard的R TclTk接口部件。它还采用了一些预制的部件,从张建华tkWidgets选择要加载的对象/文件Bioconductor包。

Mfuzzgui provides a convenient interface to most functions of the Mfuzz package without restriction  of flexibility. An exception is the batch processes such as partcoeff and cselection routines which  are used for parameter selection in fuzzy c-means clustering of microarray data. These routines are  not included in Mfuzzgui. To select various parameters, the underlying Mfuzz routines may be applied.
mfuzzgui到大部分的Mfuzz包功能没有限制的灵活性提供了一个方便的接口。批次处理,如partcoeff和cselection模糊C-均值聚类的微阵列数据中的参数选择使用的例程,是一个例外。这些例程不包括在Mfuzzgui。要选择不同的参数,底层Mfuzz例程可能被应用。

Usage of Mfuzzgui does not require assumes an pre-built exprSet object but can be used with tab-delimited text files containing the gene expression data.  Note, however, that the clustering is based on the   the ordering of samples (arrays) as of the columns in the expression matrix of the exprSet object or in the uploaded table, respectively.  Also, replicated arrays in the  expression matrix (or table)  are treated as independent by the mfuzz function and, thus, should be averagered prior to clustering.
用法的Mfuzzgui不需要假设一个预先内置的exprSet对象,但可以使用制表符分隔的文本文件包含的基因表达数据。但是请注意,聚类样本的顺序(数组)作为在exprSet对象的表达矩阵或上传表中的列,分别为基础。此外,在表达矩阵(或表)复制数组mfuzz函数视为独立的,因此,应averagered聚类。

For a overview of the functionality of Mfuzzgui, please refer to the package vignette. For a description of the underlying functions, please refer to the Mfuzz package.
概览一个功能Mfuzzgui的,请参阅包小插曲。对于底层功能的描述,请参阅Mfuzz包。


值----------Value----------

Mfuzzgui returns a tclObj object.
mfuzzgui返回tclObj对象。


注意----------Note----------

The newest versions of Mfuzzgui can be found at the Mfuzz webpage
Mfuzzgui的最新版本,可以发现在Mfuzz网页


作者(S)----------Author(s)----------


Matthias E. Futschik
(<a href="http://itb.biologie.hu-berlin.de/~futschik">http://itb.biologie.hu-berlin.de/~futschik</a>)and Lokesh Kumar



参考文献----------References----------

and Computational Biology</STRONG>, Vol. 3, No. 4, 965-988, 2005.
DJ, Davis RW,  A genome-wide transcriptional analysis of the mitotic cell cycle, <STRONG>Mol Cell</STRONG>,(2):65-73, 1998.
</ol>   <h3>See Also</h3>
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注:
注1:为了方便大家学习,本文档为生物统计家园网机器人LoveR翻译而成,仅供个人R语言学习参考使用,生物统计家园保留版权。
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