filter.std(Mfuzz)
filter.std()所属R语言包:Mfuzz
Filtering of genes based on their standard deviation.
根据其标准差的基因筛选。
译者:生物统计家园网 机器人LoveR
描述----------Description----------
This function can be used to exclude genes with
此功能可以用来排除基因
用法----------Usage----------
filter.std(eset,min.std,visu=TRUE)
参数----------Arguments----------
参数:eset
object of the class ExpressionSet.
对象类ExpressionSet。
参数:min.std
threshold for minimum standard deviation. If the standard deviation of a gene's expression is smaller than min.std the corresponding gene will be excluded.
阈值最低标准偏差。如果一个基因的表达的标准差是小比min.std相应的基因将被排除在外。
参数:visu
If visu is set to TRUE, the ordered standard deviations of genes' expression values will be plotted.
如果visu设置为TRUE,有序的基因的表达值的标准偏差将绘制。
值----------Value----------
The function produces an object of the ExpressionSet class. It is the
函数产生的ExpressionSet类的对象。这是
注意----------Note----------
As soft clustering is noise robust, pre-filtering can usually be avoided. However, if the number of genes with small expression changes is
软聚类预过滤噪声鲁棒性,通常可避免。但是,如果对基因表达的变化小的数目是
作者(S)----------Author(s)----------
Matthias E. Futschik (<a href="http://itb.biologie.hu-berlin.de/~futschik">http://itb.biologie.hu-berlin.de/~futschik</a>)
举例----------Examples----------
data(yeast) # data set includes 17 measurements[数据集包括17个测量]
yeastF <- filter.NA(yeast) # filtering of genes based on missing values [根据缺失值的基因过滤]
yeastF <- filter.std(yeastF,min.std=0.3) # filtering of genes based on standard deviation [基因筛选,基于标准偏差]
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注:
注1:为了方便大家学习,本文档为生物统计家园网机器人LoveR翻译而成,仅供个人R语言学习参考使用,生物统计家园保留版权。
注2:由于是机器人自动翻译,难免有不准确之处,使用时仔细对照中、英文内容进行反复理解,可以帮助R语言的学习。
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