R语言 methylumi包 methylumIDAT()函数中文帮助文档(中英文对照)

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methylumIDAT(methylumi)
methylumIDAT()所属R语言包：methylumi

                                         methylumIDAT
                                         methylumIDAT

                                         译者：生物统计家园网 机器人LoveR

描述----------Description----------

Read a directory of methylumi idat files and return a MethylumiSet.
阅读的methylumi IDAT文件的目录和返回MethylumiSet。


用法----------Usage----------


methylumIDAT(barcodes = NULL, pdat = NULL, parallel = F, n = T, n.sd =
F, oob = T, idatPath=getwd(), ...)



参数----------Arguments----------

参数：barcodes
A vector of barcodes to read.  Either this argument or pdat must be specified.  
一个向量，条码阅读。这种说法或pdat必须指定。


参数：pdat
A data.frame describing the samples.  A special column named "barcodes" can be used to specify the barcodes to be read.  
描述样本数据框。可以使用一种特殊的列名为“条形码”，指定要读取的条码。


参数：parallel
If TRUE, an attempt will be made to process using multiple cores on a multicore machine.  
如果是TRUE，试图将处理多核机器上使用多个内核。


参数：n

参数：n.sd

参数：oob

参数：idatPath
The path to the directory containing the idat files.  
包含IDAT文件的目录的路径。


参数：...

Details

详情----------Details----------

Read a set of .idat files and return a MethylumiSet object.
读一组。IDAT文件，并返回一个MethylumiSet对象。


值----------Value----------

A MethylumiSet object.
一个MethylumiSet对象。


作者（S）----------Author(s)----------



Tim Triche, Jr.




举例----------Examples----------


## Not run: [＃无法运行：]
if(require('IlluminaHumanMethylation450k.db')) {
  barcodes <- c('6005486014_R04C02',
              '6005486023_R05C01')
  lumi450k &lt;- methylumIDAT(barcodes,idatPath=system.file('extdata/idat',package='methylumi')) # no normalization done[完成没有标准化]
  sampleNames(lumi450k) <- c('TCGA1','TCGA2')
  show(lumi450k)
}

## End(Not run)[＃结束（不运行）]

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注：
注1：为了方便大家学习，本文档为生物统计家园网机器人LoveR翻译而成，仅供个人R语言学习参考使用，生物统计家园保留版权。
注2：由于是机器人自动翻译，难免有不准确之处，使用时仔细对照中、英文内容进行反复理解，可以帮助R语言的学习。
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