R语言 methVisual包 methCA()函数中文帮助文档(中英文对照)

loveR

methCA(methVisual)
methCA()所属R语言包：methVisual

                                        CA on methylation
                                         CA的甲基化

                                         译者：生物统计家园网 机器人LoveR

描述----------Description----------

Correspondence Analysis over methylation Data
过甲基化数据的对应分析


用法----------Usage----------


methCA(methData,file)



参数----------Arguments----------

参数：methData
List; contains information on the pairwise alignments, and methylated CpG motifs.
名单包含成对的路线，和甲基化的CpG基序的信息。


参数：file
String; optionally, quoted character string for specification of path and file  name for saving the result. By default, the result file's format is .pdf. If argument is omitted, screen output is provided only.
字符串;可选，引用指定路径和文件名保存结果的字符串。默认情况下，结果文件的格式是PDF。如果省略参数，屏幕输出。


Details

详情----------Details----------

Correspondence analysis (CA) is a multivariate statistical technique which is applicable to tables of categorical data. CA can be useful in understanding the data in a inter relationship manner, meaning the dependencies between categories. Unlike conventional statistical methods that try to prove a hypothesis, the CA is an exploratory technique that can reveal data content. With the help of a graphical application, which displays each category as a point in two dimensional plot, it is easier to locate special characteristic in the numerical data. It used in order to study the association between CpG methylation states and clone sequences based on the aligned clone sequences under study.
对应分析（CA）是一种多元统计技术，它是适用于分类数据表。 CA可以是有用的数据，在理解中的相互关系的方式表示类之间的依赖关系。不同于传统的统计方法，试图证明一个假设，CA是一项探索性的技术，可以揭示数据内容。与一个图形应用程序，其中显示每个类别在二维积点的帮助下，很容易找到特殊的特点，在数值数据。它用于为了研究甲基化状态和基于对准正在研究克隆序列克隆序列之间的关联。


值----------Value----------

CA diagram as postscript file saved in given path and name.
CA图PostScript文件保存在给定的路径和名称。


作者（S）----------Author(s)----------


Arie Zackay <arie.zackay@mail.huji.ac.il>, Christine Steinhoff <steinhof@molgen.mpg.de>



举例----------Examples----------


## using methData, file is the path to R home directory.[＃methData，文件是为R的主目录的路径。]
## In order to save methCA.pdf, make sure that you have writing [＃在为了节省methCA.pdf的，确保你写]
## permission under R.home() directory. If you do not have permission[＃许可根据R.home（目录）。如果你没有权限]
## choose your own path.[＃选择自己的道路。]
dir.create(file.path(R.home(component="home"),"/BiqAnalyzer"))  
data(methData)
methCA(methData,file=file.path(R.home(component="home"),
                        "/BiqAnalyzer/methCA.pdf"))

转载请注明:出自 生物统计家园网(http://www.biostatistic.net)。


注：
注1：为了方便大家学习，本文档为生物统计家园网机器人LoveR翻译而成，仅供个人R语言学习参考使用，生物统计家园保留版权。
注2：由于是机器人自动翻译，难免有不准确之处，使用时仔细对照中、英文内容进行反复理解，可以帮助R语言的学习。
注3：如遇到不准确之处，请在本贴的后面进行回帖，我们会逐渐进行修订。