R语言 methVisual包 makeDataMethGFF()函数中文帮助文档(中英文对照)

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makeDataMethGFF(methVisual)
makeDataMethGFF()所属R语言包：methVisual

                                        GFF methylation files
                                         GFF甲基化文件

                                         译者：生物统计家园网 机器人LoveR

描述----------Description----------

Create methData object from processed .gff files
从处理创建GFF文件methData对象。


用法----------Usage----------


makeDataMethGFF(dir,chr,start,end,meth_value)



参数----------Arguments----------

参数：dir
String; The local directory where the .gff files are located
字符串的本地目录GFF文件的位置。


参数：chr
String; Chromosome under study
正在研究的字符串;染色体


参数：start
Integer; The start position of genomic region under study
整数;所研究的基因组区域的起始位置


参数：end
Integer; The end position of the genomic region under study  
整数;在所研究的基因组区域的结束位置


参数：meth_value
double; level of methylation on CpG
双;上的CpG甲基化水平


Details

详情----------Details----------

This function reads and processes GFF files and creates a list object (like the one generated by MethAlignNW()) which can be later analyzed through the visualization, classification and clustering functions.
此功能读取和处理GFF文件，并创建一个列表对象（如MethAlignNW（）生成一个）以后可以通过可视化，分类和聚类功能分析。


值----------Value----------

methData object
methData对象


作者（S）----------Author(s)----------


Arie Zackay <arie.zackay@mail.huji.ac.il>, Christine Steinhoff <steinhof@molgen.mpg.de>



举例----------Examples----------


methGFF <- makeDataMethGFF(dir=system.file(package="methVisual",
                        "examples/GFF"),chr="7",start=0,end=70,0.75)
methGFF

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注：
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