findNonAligned(methVisual)
findNonAligned()所属R语言包:methVisual
Aligned CpG positions
不结盟的CpG位置
译者:生物统计家园网 机器人LoveR
描述----------Description----------
Determination of non-aligned CpG positions
不结盟的CpG位置的测定
用法----------Usage----------
findNonAligned(methData)
参数----------Arguments----------
参数:methData
List; contains information on the pairwise alignments, and methylated CpG motifs
名单;包含成对的路线,和甲基化的CpG基序的信息
Details
详情----------Details----------
Determination of aligned and not-aligned positions of CpGs of examined sequences in relation to genomic sequence.
有关的基因组序列的研究序列的CPGs对齐和未对齐位置的测定。
值----------Value----------
Integer matrix, where columns=CpG positions, row=clone sequences. 0 = not methylated, 1 = methylated, 2 = not aligned
整数矩阵,其中列的CpG位置,行=克隆序列。 0 =未甲基化,1 =甲基,2 =不对齐
作者(S)----------Author(s)----------
Arie Zackay <arie.zackay@mail.huji.ac.il>, Christine Steinhoff <steinhof@molgen.mpg.de>
举例----------Examples----------
data(methData)
findNonAligned(methData)
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