R语言 metahdep包 metaprep-class()函数中文帮助文档(中英文对照)

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metaprep-class(metahdep)
metaprep-class()所属R语言包：metahdep

                                        Class metaprep
                                         类metaprep

                                         译者：生物统计家园网 机器人LoveR

描述----------Description----------

This is a class representation for the effect size estimates and other summary information for a single gene, from a collection of gene expression studies, usually constructed in preparation for a meta-analysis.
这是一个规模效应的估计和其他汇总为一个单一的基因信息，从基因表达通常在准备兴建一项荟萃分析研究，收集，类表示。


类的对象----------Objects from the Class----------

Objects can be created using the function metahdep.format and new.
可以创建对象使用的功能metahdep.format和new。


插槽----------Slots----------




theta: Object of class vector representing the gene's effect size estimates (differential expression measures) from the multiple studies.
theta：Object类的vector代表从多个研究该基因的作用大小估计（差异表达的措施）。




V: Object of class matrix representing the sampling variance/covariance matrix of the gene's effect size estimates from the multiple studies.
V：Object类的matrix代表从多个研究基因的作用大小的抽样方差/协方差矩阵估计。




X: Object of class matrix representing the covariate (or design) matrix for the gene. Covariate information from the multiple studies is represented here.
X：Object类的matrix代表协（或设计）的基因矩阵。来自多项研究的协变量的信息在这里代表。




M: Object of class matrix representing the block diagonal hierarchical structure of effect size estimates from the multiple studies.
M：Object类的matrix块对角线规模效应的层次结构，从多个研究估计。




max.k: Object of class integer representing the size of the largest block on the diagonal of M, i.e., the size of the largest hierarchical dependence group for the gene.
max.k：Object类的integerM，即，规模最大的基因的层次依赖组的对角线上的最大块的大小。




row.indices: Object of class matrix with columns named Study and Row.  Optionally returned by the function metahdep.format(), to see which gene (Row) in which ES.obj object (Study) produced the data recorded in each metaprep object.
row.indices类matrix列名为研究和行对象。可选择由该函数返回metahdep.format()，看哪些基因（行）ES.obj对象（研究）在每个metaprep对象的数据记录。




gene: Object of class character representing the gene name.
gene类character代表基因名称的对象。


方法----------Methods----------




@ replace the slot entries
@替换插槽条目


参考文献----------References----------

Bioinformatics, 25(19):2619-2620.


举例----------Examples----------



###[＃]
###  See the metahdep package vignette for a full example [＃见metahdep包小插曲为一个完整的例子]
###[＃]
data(HGU.prep.list)
HGU.prep.list[[7]]


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注：
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